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绿头鸭线粒体基因组全序列分析及河鸭类系统发育
  • ISSN号:1674-7968
  • 期刊名称:《农业生物技术学报》
  • 时间:0
  • 分类:S188[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,北京100094, [2]中国农业科学院特产研究所,吉林132109, [3]江西农业大学动物科技学院,南昌330045
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30221005)和国家重点基础研究发展规划(973)(No.2006CB200100)资助.
中文摘要:

参照近源物种线粒体基因组序列设计引物15对,用PCR产物直接测序法测得绿头鸭(Anas platyrhychos)线粒体基因组全序列,初步分析其基因组特点和各基因的定位。结果显示,绿头鸭线粒体基因组全长16606bp(GenBank No.EU755253),共有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码控制区(D-loop),其组成和排列顺序与已知雁形目(Anseriforms)鸟类相似。基于GenBank已有D-loop区序列,用N-J法构建河鸭类系统进化树。结果表明,河鸭类分为3个进化枝。其中,家鸭、绿头鸭及斑嘴鸭(A.poecilorhyncha)构成一枝,初步推断我国家鸭起源于绿头鸭和斑嘴鸭,或是绿头鸭和斑嘴鸭的杂交后代。

英文摘要:

The complete mitochondrial genome (mtDNA) of mallard (Anas platyrhychos) was determined by DNA sequencing based on the PCR fragments of 15 pairs of primers. The entire genome was 16 606 bp in length(GenBank accession No,EU755253), It contained 37 genes (13 protein coding genes, 2 rRNA and 22tRNA) and a non-coding control region (D-loop). The characteristics of mtDNA resembled to birds on Anseriforms. Based on the control region in GenBank, Phylogenetic trees constructed using the N-J method indicated that the 13 species of Anatini were clustered in three major clades. Among them, the mallards, domestic duck and spot-billed duck (A. poecilorhyncha) clustered in the same one. The results support that domestic ducks origined from mallard and spot-billed duck. Both of mallard and spot-billed duck contributed to domestic duck evolution.

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期刊信息
  • 《农业生物技术学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:武维华
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农大生命科学楼1053
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  • 电话:010-62733684 62731615
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7968
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3342/S
  • 邮发代号:2-367
  • 获奖情况:
  • 在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010年)...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
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