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云台山白云岩表层土可培养细菌多样性
  • ISSN号:0258-7971
  • 期刊名称:《云南大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q938.1[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]贵州师范大学生命科学学院,贵州贵阳550001, [2]云南大学云南省微生物研究所,云南昆明650091
  • 相关基金:贵州省科技支撑计划(黔科合SY字〔2012〕3183,〔2012〕3182); 云南省应用基础研究项目(2014FB104); 贵州师范大学大学生科研创新计划项目(10003)
中文摘要:

运用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析贵州云台山白云岩表层土可培养细菌的多样性.稀释涂布平板分离共获得131株细菌,限制性内切酶HhaⅠ和HaeⅢ对扩增的16S rRNA基因片段进行酶切分型,根据ARDRA酶切图谱划分为40个操作分类单元.16S rRNA基因序列测定和系统发育分析结果显示,这些菌株隶属于包括厚壁菌门(Firmicutes,64.89%)、β-变形菌纲(β-Proterbacteria,3.82%)、γ-变形菌纲(γ-Proterbacteria,17.56%)、放线细菌门(Actinobacteria,11.45%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,3.82%)等5大类群,共13个属.优势菌群为芽胞杆菌属(Bacillus,53.44%),亚优势菌群为寡养单胞菌属(Stenotrophomonas,9.16%)、假单胞菌属(Pseudomonas,8.40%)和微小杆菌属(Exiguobacterium,8.40%).15.00%的有效序列与Gene Bank已知序列相似性小于等于97%,可能为潜在新类群.研究表明,云台山白云岩喀斯特地区不仅含有较为丰富的细菌物种多样性,且潜藏着许多新的微生物资源.

英文摘要:

Phylogenetic diversity of cultivable bacterium in the topsiol of the dolomite rocks from Yuntai Mountain was analyzed based on the culture- dependent method and 16 S rRNA gene sequence analysis. One hundered and thirty- one bacterial strains were isolated by using the standard dilution- plating technique. Restriction enzyme of Hha Ⅰ and Hae Ⅲ were applied in ARDRA to analyze the 16 S rRNA gene sequences,and 40 operational taxonomic units were assigned on the basis of the ARDRA patterns. The phylogenetic analysis based on the 16 S rRNA genes homology showed that all isolates affiliated to 11 genera,5 phyla including Firmicutes( 64. 89%),β- Proterbacteria( 3. 82%),γ- Proterbacteria( 17. 56%),Actinobacteria( 11. 45%) and Bacteroidetes( 3. 82%). Bacillus( 53. 44%) dominated among the isolates,and followed by Stenotrophomonas( 9.16%),Pseudomonas( 8. 40%) and Exiguobacterium( 8. 40%). Additionally,15% of strains showed similarity equal to or less than 97% in 16 S rRNA sequences and may represent novel species. The results show that the diversity of cultivable bacterial species is abundant,and potential novel species exist on the dolomite from the karst area of Yuntai Mountain.

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期刊信息
  • 《云南大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:云南省教育厅
  • 主办单位:云南大学
  • 主编:张力
  • 地址:昆明市呈贡新区
  • 邮编:650500
  • 邮箱:yndxxb@ynu.edu.cn
  • 电话:0871-5033829 5031498 5031662
  • 国际标准刊号:ISSN:0258-7971
  • 国内统一刊号:ISSN:53-1045/N
  • 邮发代号:64-29
  • 获奖情况:
  • 1999年荣获全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀...,1997年荣获全国第二届优秀科技期刊评比二等奖,1995年全国重点大学优秀科技期刊评比二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11696