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人参β-actin基因实时荧光定量PCR方法的建立
  • ISSN号:0253-2670
  • 期刊名称:《中草药》
  • 时间:0
  • 分类:R282.12[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:[1]吉林农业大学中药材学院,吉林长春130118
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31270371); 国家科技支撑计划项目(2011 BA I03B01-02); 吉林省科技成果转化项目(20125068)
中文摘要:

目的建立人参β-actin基因实时荧光定量PCR的方法。方法根据GenBank上其他高等植物β-actin基因保守区域设计一对特异性引物,将从人参中PCR扩增得到的β-actin基因克隆到pMD20-T载体上构建重组质粒,经1/10梯度稀释后用于制定标准曲线,并进行反应的灵敏性、特异性和重复性试验。结果该方法检测β-actin基因的最低拷贝数为43拷贝/μL,在较广的范围内(43~4.3×107拷贝/μL)有良好的线性关系(R2=0.995 3);熔解曲线分析显示扩增产物为特异性单峰,其Tm值为(84.51±0.01)℃;5个不同浓度对照品组内试验变异系数为0.58%~2.79%,组间试验变异系数为2.61%~4.41%。结论该方法具有快速、灵敏、特异、高通量及重复性强等优点,为β-actin基因作为内参基因进行人参功能基因表达的定量分析提供了方法学基础。

英文摘要:

Objective To construct a real-time fluorescence quantitative RT-PCR method for the β-actin gene of Panax ginseng. Methods According to the β-actin gene of other higher plants available in Genbank, A pair of primers weredesigned and the amplified fragment of β-actin gene was linked with pMD20-T vector to construct recombinant plasmids. Then the positive plasmids were diluted and the standard curve was established. The sensitivity, specificity, and repeatability were detected. Results The results showed that the lowest copy number for detection of β-actin gene with this method was 43.0 copies/μL, and there was a good linear relationship in a wide range from 43 to 4.3 × 107 copies/μL(R2 = 0.995 3). The melting curve showed a single peak with the temperature of(84.51 ± 0.01) ℃. The coefficient of variation(CV) of five different concentration of positive plasmids was 0.58% to 2.79% and 2.61% to 4.41% in intra-assay and inter-assay, respectively. Conclusion The method established in this paper has the advantage of rapidity, sensitivity, specificity, high throughput, and good repeatability, which provides a methodological basis for the quantitative analysis on the functional genes of P. ginseng when β-actin gene is taken as a reference gene.

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期刊信息
  • 《中草药》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:天津市科委
  • 主办单位:中国药学会 天津药物研究院
  • 主编:汤立达
  • 地址:天津市南开区鞍山西道308号
  • 邮编:300193
  • 邮箱:zcy@tiprpress.com
  • 电话:022-27474913 23006821
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2670
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1108/R
  • 邮发代号:6-77
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双奖”期刊,1992年获国家科委、中共中央宣传部、国家新闻出版...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:90909