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‘南林895’杨PdNAC1基因克隆及蛋白的亚细胞定位
  • ISSN号:1000-2006
  • 期刊名称:《南京林业大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:S722[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]南京林业大学南方现代林业协同创新中心,江苏南京210037, [2]南京林业大学杨树种质创新与品种改良重点实验室,江苏南京210037
  • 相关基金:国家林业公益性行业科研专项项目(201304111);国家自然科学基金项目(31200507);江苏省基础研究计划(自然科学基金)-面上研究项目(BK2012817);江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
中文摘要:

以‘南林895’杨(Populus deltoides×P.euramericana cv ‘Nanlin895’)为材料,通过RACE-PCR技术,获得了NAC1基因的全长cDNA,命名为PdNAC1。该序列含有1个长906 bp的开放阅读框,编码302个氨基酸。该蛋白的分子质量为34.23 ku,等电点为7.44。分析其氨基酸序列发现,该蛋白具有典型NAC转录因子特征,NAM结构域位于11-135个氨基酸之间,含有A、B、C、D、E 5个亚结构域,该区域可以结合DNA;而C端含有一个高度变异的转录激活区。利用杨树原生质体对PdNAC1蛋白进行细胞亚定位,结果发现PdNAC1不仅明显定位于细胞核中,而且在细胞膜上也有表达。但PdNAC1是否具有相应的跨膜结构域尚不明确。

英文摘要:

NAC transcription factors are the key transcription regulatory factors which involved in plant multiple biologi.cal functions, such as plant development, hormones regulation, and environmental stimuli. The full length cDNA se.quence of a NAC.like gene from the hybrid of Populus deltoides × P. euramericana cv‘Nanlin895’ , was cloned by RT.PCR and RACE methods, named PdNAC1, which contains an ORF of 906 bp and encodes 302 amino acids with the mo.lecular weight of about 34.23 ku ond pI of 7.44. The putative protein sequence analysis showed that PdNAC1contained conserved NAC domain including five sub.domains A, B, C, D, and E which can bind DNA. Meanwhile, the C.termi.nal of PdNAC1 is highly different and that is very typical in NAC transcription factors. Furthermore, the results of sub.cellular localization in poplar protoplast showed that the PdNAC1 transcription factor is mainly located in the cell nucle.us, but also translocated on the cell membrane. However,further investigation would be needed to reveal whether the Pd.NAC1 is corresponding to transmembrane domain.

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期刊信息
  • 《南京林业大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:江苏省教育厅
  • 主办单位:南京林业大学
  • 主编:曹福亮
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  • 邮编:210037
  • 邮箱:xuebao@njfu.edu.cn
  • 电话:025-85428247 85427076
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2006
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1161/S
  • 邮发代号:28-16
  • 获奖情况:
  • 全国高校优秀学术期刊一等奖、江苏省自然科学学报...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国科学文摘数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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