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甘蓝型油菜BnFAD8基因编码序列的克隆和表达谱分析
  • ISSN号:0490-6756
  • 期刊名称:《四川大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064
  • 相关基金:国家自然科学基金(30471095)
中文摘要:

通过比对拟南芥等同源基因,克隆了甘蓝型油菜FAD8基因中的保守序列.以得到的FAD8(Fatty Acid Desaturase 8)保守序列片段为信息探针,在GenBank的EST数据库中检索高度同源的EST,并通过人工拼接及RT—PCR得到油菜该基因的全长为1299bp的cDNA序列,命名为BnFAD8.序列分析结果中发现该基因符合质体定位的∞3脂肪酸脱饱和酶序列特征.通过比较22℃和8℃处理的甘蓝型油菜的BnFAD8基因表达谱,发现该基因在常温下仅存在痕量表达;而在低温条件下在叶中表达出现较大幅度的升高.推测BnFAD8基因和油菜的低温调控存在联系.

英文摘要:

Brassica napus fatty acid desaturase 8 (FADS) belongs to cold-induced omega 3 fatty acid desaturase. By aligning Arabidopsis FAD8 and other homologous FAD8 genes, one highly conserved sequence of FAD8 from rape was cloned in study. Using the FAD8 conserved sequence as a querying probe, highly homologous EST were obtained from database of GenBank and a putative complete ORF of 1299 bp (named. BnFAD8) was assembled according to the rape clone. Furthermore, the full length cDNA of Brassica napus FAD8 was cloned by RT-PCR with two primers designed based on this assembled cDNA sequence. Features of plasmid-located 0o3 fatty acid desaturase were found in sequence analy- sis of cDNA cloned. As shown in expression profile result, BnFAD8 was highly expressed in leaves at 8 ℃, but only trace-level expression in leaves at 22 ℃, which suggested that BnFAD8 involved in the process of rape cold acclimation.

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期刊信息
  • 《四川大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国家教育部
  • 主办单位:四川大学
  • 主编:刘应明
  • 地址:成都九眼桥望江路29号
  • 邮编:610064
  • 邮箱:
  • 电话:028-85410393 85412393
  • 国际标准刊号:ISSN:0490-6756
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1595/N
  • 邮发代号:62-127
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,四川省十佳科技期刊,教育部全国高校优秀学报二等奖(1995,1999),四川省科技优秀期刊一等奖(1996,2000)
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:10542