位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
利用基因组发掘技术指导链霉菌SH-62中活性天然产物的分离及鉴定
  • ISSN号:0439-8114
  • 期刊名称:《湖北农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.9[生物学—微生物学]
  • 作者机构:华中农业大学农业微生物学国家重点实验室,武汉430070
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31270136); 教育部留学回国人员科研启动基金项目([2009]1590);教育部新世纪人才支持计划项目(NCET-08-0779)
中文摘要:

通过生物信息学分析,利用基因组发掘技术发现链霉菌SH-62基因组中至少含有37个次级代谢产物的生物合成基因簇,除了有4个基因簇分别与已知的肠道菌素、潮霉素A、尼日利亚菌素和格尔德霉素的生物合成基因簇具有高度同源性以外,其他基因簇的功能鲜见报道。在不同发酵培养基上培养链霉菌SH-62,利用高分辨率的LC-MS对发酵产物进行分析,发现链霉菌SH-62确实能够产生肠道菌素、潮霉素A和尼日利亚菌素,从而证明了基因组发掘策略确实能够指导代谢产物的分离及鉴定。

英文摘要:

There were at least 37 gene clusters for biosynthesis of secondary metabolites which were found in the genome of Streptomyces. sp. SH-62 by bioinformatics analyses. Besides 4 of them were highly homologous with the well-known biosynthetic gene clusters of enterocin, hygromycin A, nigericin and geldanamycin, respectively, biological functions of others had not been reported yet. Production of enterocin, hygromycin A and nigericin was detected by high-resolution LC-MS analyses of the Streptomyces. sp. SH-62 fermentation products in different media. It demonstrated that the genome mining strategy is feasible to direct detection and identification of metabolites.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《湖北农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖北省农业科学院
  • 主办单位:湖北省农业科学院 华中农业大学 长江大学
  • 主编:焦春海
  • 地址:武汉市武昌南湖瑶苑1号省农业科学院内
  • 邮编:430064
  • 邮箱:hbnykxxzz@126.com
  • 电话:027-87389334
  • 国际标准刊号:ISSN:0439-8114
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1255/S
  • 邮发代号:38-21
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,全国农业核心期刊,湖北省优秀期刊,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30537