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基于形状特征的硅藻显微图像自动识别
  • ISSN号:0438-0479
  • 期刊名称:厦门大学学报(自然科学版)
  • 时间:2011
  • 页码:690-696
  • 分类:Q949.2[生物学—植物学] TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室,福建厦门361005
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(41076079,40627001); 厦门大学科技创新项目(Y07018)
  • 相关项目:海洋硅藻硅质壳变形的特征与生态学机制
中文摘要:

硅藻是一类广泛分布于各类生境的单细胞生物,在许多领域具有广泛的应用,如水质监测、环境调查、石油勘探等,而这些应用都离不开对硅藻的种类鉴定.根据硅藻显微图像的形状特点,提出了对其进行预处理、分割、形状特征提取和分类的自动识别方法.采用了基于累积直方图的双轮廓叠加法的图像分割方法,可以有效抑制光照强度不一致、不平衡的影响,并充分利用显微镜下硅藻图像的轮廓特点,获得较好分割效果.同时对硅藻图像提取几何描述全局特征及形状签名特征,最后采用了基于误差反向传播算法的多层前馈网络(BP网络)进行分类.实验表明,该方法对11种浮游硅藻(包括12类轮廓)的自动识别率达到96.6%.

英文摘要:

Diatoms are unicellular microscopic algae found in practically any moist environment.Identification of diatom has applications in many disciplines,including water quality monitoring,environment investigation and oil exploration.In this research,a method based on contour features for automatic identification of digital microscopic images of diatoms is presented.This method includes image preprocessing,image segmentation,contour features extraction and classification.At the stage of image segmentation,the best results were obtained by a double contours surperposition method based on accumulation histogram,which makes full use of the characters of diatom contour and reduces effects of nonuniform illumination.Then we extracted morphometric descriptors global features and shape signature features from diatom,and finally use a BP neural network to effectively classify the diatoms.With classification carried out using a BP neural network we attained 96.6% accuracy from a set of images containing 11 species of diatoms which have 12 kinds of contours.

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期刊信息
  • 《厦门大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:厦门大学
  • 主编:谢素原
  • 地址:厦门市思明南路422号厦门大学嘉庚三 817-819室
  • 邮编:361005
  • 邮箱:jxmu@xmu.edu.cn
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  • 国际标准刊号:ISSN:0438-0479
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1070/N
  • 邮发代号:34-8
  • 获奖情况:
  • 多次被评为全国、华东地区、福建省的优秀科技期刊,2001年入选国家新闻出版总署评定的"中国期刊方阵",2003年获国家新闻出版总署颁发的"第二届国家科技...,2006年获国家教育部科技司颁发的"首届中国高校精...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国科学文摘数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
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