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黄曲条跳甲双孔道钾离子通道基因序列特征及不同组织的表达量分析
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:南京农业大学学报
  • 时间:2012
  • 页码:69-74
  • 分类:Q966[生物学—昆虫学]
  • 作者机构:[1]仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所,广东广州510225
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31101500); 仲恺农业工程学院校级科研基金项目(G3100005)
  • 相关项目:黄曲条跳甲产卵节律的主钟和子钟研究
中文摘要:

昆虫细胞膜钾离子通道与多种生命活动密切相关。结合转录组测序及荧光定量PCR技术,鉴定和分析黄曲条跳甲(Phyllotreta striolata(Fabricius))钾离子通道基因的序列特征及不同组织器官的mRNA表达谱。结果表明:所获得的钾离子通道蛋白基因(twk)cDNA的开放阅读框为1 137 bp,共编码378个氨基酸残基。蛋白结构分析表明:其含有4个钾离子通道蛋白的跨膜区(M1~M4)和2个孔道结构域(1P~2P),分别位于M1与M2、M3与M4之间,即双孔道钾离子通道。序列保守性分析表明:1P的核心序列为甘氨酸-酪氨酸-甘氨酸(GYG)模体,2P的核心序列为甘氨酸-亮氨酸-甘氨酸(GLG)模体。荧光定量PCR分析表明,twk在黄曲条跳甲雌雄成虫的不同部位中都有表达,但是在精巢或卵巢、中肠和头部的表达量相对较高;雌、雄成虫各组织器官之间的相对表达量没有显著差异。

英文摘要:

Potassium channel participate in the adjustment biology in a variety of physiological process.The expressed sequence tag(EST)of two-P domain K+ channel(twk)was clustered and identified from transcriptome data of Phyllotreta striolata(Fabricius).Gene expression profiles in different tissues were analyzed by quantitative real-time PCR.This cDNA was 1 137 bp in length with an open reading frame(ORF)encoding 378 amino acids.The putative protein molecular contained 4 transmembrane helixs(M1-M4)and 2 pore domains(1P-2P),locating between M1 and M2,M3 and M4.Conservation elements analysis showed that the core sequences of 1P is GYG motif,and the core sequences of 2P is GLG motif.Quantitative real-time PCR assay showed that a relatively higher expression amount of twk gene was found in testis or ovary,midgut and head than that in other tissues.There were no significance differences of twk expression profile between male and female adults.

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期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558