近些年来,基于P2P的僵尸网络凭借其网络通信的隐蔽性和网络连接的健壮性特点,逐渐成为国内外研究的热点。针对两层架构的P2P僵尸网络的命令控制(Command and Control简称C&C)协议进行了深入探讨与分析,并设计了超级节点更新邻居节点的算法,超级节点分发命令算法,并将公钥加密算法应用到P2P僵尸网络的命令控制协议中,增加了僵尸网络通信的隐蔽性和网络的健壮性。同时,对该类型的僵尸网络中普通节点接收命令时的流量和超级节点转发命令时的流量进行了模拟仿真,仿真结果证明了节点的心跳流量和命令流量与用户的正常上网流量相比较而言微乎其微。最后,对该类型的P2P僵尸网络提出了防御策略的相关建议。