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Revaluation of deuterostome phylogeny and evolutionary relationships among chordate subphyla using mitogenome data
  • ISSN号:1673-8527
  • 期刊名称:《遗传学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q95[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]Key Laboratory of Ministry of Education for Coastal and Wetland Ecosystems, School of Life Sciences, Xiamen University, Xiamen 361005, China
  • 相关基金:This work was supported by the National Natural Science Foundation of China (No. 30570208 and 30830023) and the Specialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education from the Ministry of Education, China (No. 20070384041).
中文摘要:

在课本中的传统的知识显示头索动物是到在所有现存有机体之中的脊椎动物的近亲。然而,这条意见被几最近的种系发生的研究用几百原子基因质问。研究人员建议了那 urochordates,然而并非头索动物,应该是最靠近的生活 relatives to 脊椎动物。在现在的学习,由使用从几百产生的数据, mtDNA 定序,我们再评价 deuterostome 发展史以整个 mitochondrial 染色体(mitogenomes ) 。我们的结果坚定地证明每现存 deuterostome 数和脊索动物潜水艇数是单音的门。但是结果介绍取决于不同顺序数据集的种系发生的树在分析使用了的几种选择。尽管没有清楚的种系发生的关系被获得,那些树显示古老的普通祖先多样化很快此后不久他们的外观在早寒武纪并且在一个短历史的时期期间产生了所有主要 deuterostome 系,它与“寒武纪的爆炸”一致由古生物学家揭示了。是 520-million-year 的进化遮住现存 deuterostomes 的种系发生的关系。因此,我们断定综合分析来临而非简单地,用更多的 DNA,序列应该被采用探讨远进化关系。

英文摘要:

The traditional knowledge in textbooks indicated that cephalochordates were the closest relatives to vertebrates among all extant organisms. However, this opinion was challenged by several recent phylogenetic studies using hundreds of nuclear genes. The researchers suggested that urochordates, but not cephalochordates, should be the closest living relatives to vertebrates. In the present study, by using data generated from hundreds of mtDNA sequences, we revalue the deuterostome phylogeny in terms of whole mitochondrial genomes (mitogenomes). Our results firmly demonstrate that each of extant deuterostome phyla and chordate subphyla is monophyletic. But the results present several alternative phylogenetic trees depending on different sequence datasets used in the analysis. Although no clear phylogenetic relationships are obtained, those trees indicate that the ancient common ancestor diversified rapidly soon after their appearance in the early Cambrian and generated all major deuterostome lineages during a short historical period, which is consistent with "Cambrian explosion" revealed by paleontologists. It was the 520-million-year's evolution that obscured the phylogenetic relationships of extant deuterostomes. Thus, we conclude that an integrative analysis approach rather than simply using more DNA sequences should be employed to address the distant evolutionary relationship.

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期刊信息
  • 《遗传学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院遗传与发育生物学研究所 中国遗传学会
  • 主编:薛勇彪
  • 地址:北京市安定门外大屯路中科院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:ycxb@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-8527
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5450/R
  • 邮发代号:2-819
  • 获奖情况:
  • 1996年获中科院优秀期刊二等奖,1997年获全国优秀期刊三等奖,200年获中科院优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17519