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三种摇蚊幼虫RAPD扩增条件的优化及在昆虫系统发育分析中的应用
  • ISSN号:2095-1353
  • 期刊名称:《应用昆虫学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q969.442.6[生物学—昆虫学] S794.3[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学水产学院,武汉430070
  • 相关基金:国家自然资金资助项目(30470342);教育部博士学科点专项基金(20020504001).
中文摘要:

为了研究摇蚊科昆虫种群遗传的多样性,以促进对其资源的合理保护,以萨摩亚摇蚊Chironomus samoensis Edwards基因组DNA为模板,对摇蚊幼虫的RAPD扩增条件进行优化,建立了摇蚊幼虫RAPD扩增反应的最佳体系:按照利用优化的RAPD扩增条件进行研究,实验有着良好的重现性.用16个随机引物对3种摇蚊幼虫类群各10个个体进行RAPD扩增,其中萨摩亚摇蚊共扩增出78个条带,多态座位率为41.03%,Shannon遗传多样性指数为0.2570,群体内相似度为0.8730;红裸须摇蚊Propsilocerus akamusi(Tokunaga)共75个条带,多态座位率为44.0%,Shannon遗传多样性指数为0.2472,群体内相似度为0.8731;刺铗长足摇蚊Tanypus punctipennis(Fabricius)共67个条带,多态座位率为41.79%,Shannon遗传多样性指数为0.1943,群体内相似度为0.9066.聚类分析结果表明,刺铗长足摇蚊与红裸须摇蚊的亲缘关系较近.

英文摘要:

In order to reveal the genetic diversity of chironomid population, and the protect of its resource, the genomic DNA of Chironomus samoensis Edwards was used as template to optimize RAPD amplified reaction conditions for chironomid larvae. A high reproducibility was obtained with the optimized experiment conditions. The genetic diversity of three chironomid larvae populations (C, samoensis, Propsilocerus akamusi (Tokuraga) and Tanypus punctipennis Fabricius) were analyzed. Sixteen random primers were used to amplifying 10 individuals DNA of each populations. Total 78 bands were amplified, and the percent of polymorphic loci was 41.03 in C. samoensis, 75 bands and 44.00 percent of polymorphic loci in, P. akamusi, and 67 bands and 41.79 percent of polymorphic loci in T. punctipennis. The similarity of their RAPD bands accounted for 0.8730, 0.8731 and 0.9066, respectively. The relationship between T. punctipennis and P. akamusi is relative close by UPGM, A method.

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期刊信息
  • 《应用昆虫学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:戈峰
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院5号中科院动物所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:entom@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807137
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1353
  • 国内统一刊号:ISSN:11-6020/Q
  • 邮发代号:2-151
  • 获奖情况:
  • 96、2000年获中科院《优秀期刊三等奖》,92年获中国科协《优秀学术期刊一等奖》,2001进入“中国期刊”方阵,“双百”期刊,排名第96位
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3170