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刺激隐核虫LAMP检测方法的建立
  • ISSN号:1008-0589
  • 期刊名称:《中国预防兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.7[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211
  • 相关基金:长江学者和创新团队发展计划(IRT0734);农业部公益性行业科研专项(200903029)
中文摘要:

为提高大黄鱼刺激隐核虫病的病原体检出率,本研究针对刺激隐核虫(Cryptocaryon irritans)18S-ITS2基因序列设计4条LAMP引物,在内外引物浓度比2:l-6:1、Mg^2+浓度2mmol/L、反应温度61℃-66℃、反应时间60min的优化条件下,扩增产物经电泳后呈现特异性的LAMP梯形条带。本研究建立的LAMP方法具有高灵敏度(10^-7 ng/μLDNA浓度),比常规PCR方法高100倍。将该方法应用于采集自不同地域的虫体样本、病鱼和水样以及不同组织样品的检测,结果在13份样品中有10份检出阳性,并显示该方法既能够检测发病鱼,也能够检出已感染但未发病的鱼。实验表明,该方法是一种能够快速、简易、特异、敏感地检测海水鱼类刺激隐核虫病的病原学检测方法。

英文摘要:

To improve the detection rate of Cryptocaryon irritans on Pseudosciaena crocea (Richardson). A set of four primers were designed based on the sequence of the 18S-ITS2 of C.irritans for the use of the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay. The assay conditions was optimized as following: 2:1 to 6:1 inner primer concentration ratio, 2 mmol/L of Mg^2+, at 61 ℃ to 66 ℃ for 60 min. LAMP amplification products had ladder-like bands when electrophoresed on an agarose gel. The detection limit of the assay was about 10^-7 ng/μL of C.irritans DNA. Hence, the sensitivity of LAMP assay was 100-fold higher than the standard PCR protocol. The assay was applied to detact the presence of C.irn'tans in parasite, diseased fish and water samples collected from different region, as well as different tissue samples. Ten positive were detected in 13 samples. This study showed LAMP assay could be used not only to diagnose the infected fishes, but also to detect the carrier of C.irritans as well. The LAMP assay is a rapid, simple, specific and sensitive test to diagnose for marine fish pathogenic C.irritans.

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期刊信息
  • 《中国预防兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
  • 主编:步志高
  • 地址:哈尔滨市香坊区哈平路678号
  • 邮编:150001
  • 邮箱:zgyfsyxbhvri@163.com
  • 电话:0451-51051811 51051812
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0589
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1417/S
  • 邮发代号:14-70
  • 获奖情况:
  • 全国农业优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12844