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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒strand-specific荧光定量RT-PCR检测方法的建立
  • ISSN号:1008-0589
  • 期刊名称:《中国预防兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.65[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2014CB542700);上海市重点基础研究项目(11JC1415200);科研院所技术开发研究专项(2012EG134237);上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2012)第2-5号]
中文摘要:

为了解高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的复制和转录机制,准确定量其在复制过程中基因组不同类型RNA (vRNA和cRNA)的含量,本研究根据PRRSV基因组Nsp12基因设计含有链特异性标签的特异性引物,建立了一种针对病毒基因组不同链RNA的strand-specific荧光定量RT-PCR方法.结果表明,以重组质粒标准品构建的标准曲线在101拷贝/μL~107拷贝/μL范围内具有良好的线性关系,对vRNA和cRNA的检测下限为7.40拷贝/μL和6.52拷贝/μL,能够特异性的区分病毒复制过程中产生的vRNA链和cRNA链,具有很高的特异性、灵敏性和重复性.HP-PRRSV感染MARC-145细胞后不同时间段检测vRNA和cRNA含量显示,病毒不同链RNA含量在感染过程中持续增加,vRNA和cRNA含量在感染后24 h约为7.0×107拷贝/μL和7.2×106拷贝/μL.本研究建立的方法可以用于区分和定量PRRSV在复制过程中产生的不同链RNA,为研究病毒的复制和致病机理提供了一种有效的检测手段.

英文摘要:

To differentially detect and quantify the types of viral RNA (i.e.,vRNA and cRNA) in highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus (HP-PRRSV) infected cells,a strand-specific real-time RT-PCR assay was established to distinguish the viral RNAs of HP-PRRSV based on the specific primers tagged Nsp12 gene.The results showed that the assay had a linear relation was in the range from l01 copies/μL to 107 copies/μL.The real-time RT-PCR ensured the specificity for quantifying the two types of RNA and features high specificity,sensitivity and repeatability.In addition,the vRNA and cRNA levels were detected in MARC-145 cells infected with HP-PRRSV at different time points post-infection (PI).The data showed that the copy numbers of the two RNAs gradually increased throughout the infection,and the vRNA increased to 7.0× 107 copies/μL and cRNA was to 7.2 ×l06 copies/μL at 24 hours PI.These data demonstrated that strand-sprecific real-time RT-PCR could be used to quantify the different types of RNA in PRRSV infection and could be an effective method for the investigation of replicantion and pathogenesis of HP-PRRSV.

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期刊信息
  • 《中国预防兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所
  • 主编:步志高
  • 地址:哈尔滨市香坊区哈平路678号
  • 邮编:150001
  • 邮箱:zgyfsyxbhvri@163.com
  • 电话:0451-51051811 51051812
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0589
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1417/S
  • 邮发代号:14-70
  • 获奖情况:
  • 全国农业优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12844