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香蕉穿孔线虫28S rRNA基因的D2/D3区序列分析
  • ISSN号:1000-2421
  • 期刊名称:华中农业大学学报
  • 时间:0
  • 页码:1571-1573
  • 语言:中文
  • 分类:S432.45[农业科学—植物病理学;农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193, [2]中国农业科学院研究生院,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金(30671363)、国家”十一五”科技支撑计划(2006BAD08A14,2006BADOSA08)和公益性行业(农业)科研专项(nyhyzx07-050)资助
  • 相关项目:危险性外来入侵香蕉穿孔线虫分子生物学特征研究
中文摘要:

采用线虫通用引物D2A和D3B对9个香蕉穿孔线虫种群的核糖体DNA 28S大亚基的D2/D3区进行了扩增,获得的片段长度约为780bp,克隆测序后使用UPGMA法进行聚类分析和构建系统发育树。结果表明9个线虫种群D2/D3区核苷酸序列相似性为99.13%,其中8个群体的序列与越南报道的香蕉穿孔线虫近源种(Radopholus sp.7B VietNam)的D2/D3区核苷酸序列(DQ328712)相似性为97.46%,说明香蕉穿孔线虫D2/D3区具有较大的保守性。聚类分析结果表明,RSHN12r、RSSH、RSHL、RSHK、RSLZ、RSSZ、RSHN13、RSHN12p等8个种群聚为一类,亲缘关系很近,RSHN3群体与以上8个群体亲缘关系较远,说明RSHN12r、RSSH、RSHL、RSHK、RSLZ、RSSZ、RSHN13、RSHN12p这8个香蕉穿孔线虫种群可能来源于同一地理种群,而RSHN3种群可能来源于另一个地理种群。

英文摘要:

The amplification of D2 and D3 fragments of the 28S rRNA gene from Radopholus sirnilis populations detected from imported seedling and horticultural plants using universal primers(D2A and D3B) yielded one fragment about 780 bp. The results of D2 and D3 fragment sequence analysis and the alignment between the nine populations and related species Radopholus and Pratylenchus using UPGMA method showed that eight populations(RSHN12rR, RSSH, RSHL, RSHK, RSLZ, RSSZ, RSHN13) were clustered in the same group and the similarity between them was 99. 13%, while they were compared with the sequence of Radopholus sp. 7B VietNam(DQ328712), the similarity was 97.46%. The results of phylogentic analysis with UPGMA program showed that there were two main branches, the first branch contained eight populations of R. similis (RSHN12rR, RSSH, RSHL, RSHK, RSLZ, RSSZ, RSHN13,RSHN12p), they may have the same origin. And the second branch comprised of only one population(RSHN3) which may have another origin.

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期刊信息
  • 《华中农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
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  • 主编:张献龙
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  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2421
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1181/S
  • 邮发代号:38-120
  • 获奖情况:
  • 1997年,获第二届全国优秀科技期刊二等奖,1999年,获全国高校自然科学学报及教育部优秀期刊...,2001年,选入新闻出版署期刊方阵“双百”期刊,连续三次入选教育部中国高校精品科技期刊,2009年,获全车高校科技期刊优秀编辑质量奖,2010年,被评为湖北省十大有影响学术期刊(自然科...,2012年获“第四届中国高校优秀科技期刊奖”及“第...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22122