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基因芯片图像高亮噪声处理算法研究
  • ISSN号:0438-0479
  • 期刊名称:《厦门大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:TP391.41[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]厦门大学模式识别与智能系统研究所,福建厦门361005, [2]重庆工学院计算机学院,重庆400050, [3]集美大学信息工程学院,福建厦门361021
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(60443004),重庆市自然科学基金(2007BB2415)资助
中文摘要:

基因芯片图像噪声处理决定了后续处理与分析的精度和准确性.高亮斑点噪声是一种亮度很高、成块状的特殊噪声,应用传统噪声处理方法无法滤除.针对高亮噪声的特点,首先利用形态学碟形结构元素进行开运算来评价图像是否含有噪声,然后利用阈值分割去除噪声.提出两种阈值获取方法,一种是基于最大类问方差的自适应获取方法,一种是固定阈值法.通过大量定性和定量实验比较分析,结果表明,两种方法都可以有效除高亮斑点噪声.

英文摘要:

Microarray image noise reduction determines the precision and veracity of microarray data processing and information extraction. Highly fluorescent noise is a type of special noise with higher brightness and shape in block which can't be removed by traditional methods. According to the feature of it, this paper proposes that using mathematical morphology opening operator with disk structure element to evaluate image quality, then suppress the noise with thresholding segmentation techniques. Two methods are put forward to get threshold:one is the adaptive method based on maximum variance between clusters, another is the fixed means. Through comparison and analysis, the lots of experiment results show that both two methods can effectively remove the highly fluorescent noise and preserve edge and detailed information.

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期刊信息
  • 《厦门大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:厦门大学
  • 主编:谢素原
  • 地址:厦门市思明南路422号厦门大学嘉庚三 817-819室
  • 邮编:361005
  • 邮箱:jxmu@xmu.edu.cn
  • 电话:0592-2180367 2187731
  • 国际标准刊号:ISSN:0438-0479
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1070/N
  • 邮发代号:34-8
  • 获奖情况:
  • 多次被评为全国、华东地区、福建省的优秀科技期刊,2001年入选国家新闻出版总署评定的"中国期刊方阵",2003年获国家新闻出版总署颁发的"第二届国家科技...,2006年获国家教育部科技司颁发的"首届中国高校精...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国科学文摘数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16575