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南海东北部珠江口盆地沉积物中古菌群落垂向分布研究
  • ISSN号:1007-6336
  • 期刊名称:《海洋环境科学》
  • 时间:0
  • 分类:X172[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]中国海洋大学海洋生命学院,青岛266003, [2]海洋环境与生态教育部重点实验室,青岛266100, [3]青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学功能实验室,青岛266071, [4]中国海洋大学环境科学与工程学院,青岛266100
  • 相关基金:中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室、青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生态与环境科学开放课题(KLMEES201601); 国家自然科学基金(41620104001,41521064)
中文摘要:

本文利用高通量测序及荧光定量PCR技术对南海东北部珠江口盆地柱状沉积物的表层(0-1cm)、中层(20-21 cm)和底层(40-41 cm)3个样品中古菌群落结构及其垂向分布进行了研究。结果表明,沉积物中的古菌主要可被划分为奇古菌门、Woesearchaeota、深古菌门和广古菌门。表层样品中的古菌群落多样性和丰富度最低,类群Marine Group I(MGI)占绝对优势,中层和底层样品中的古菌则以MGI、Group C3、Marine Benthic Group B、Thermoplasmata为主要类群。执行氨氧化功能的亚硝化侏儒菌属(Nitrosopumilus)是研究区域的优势类群,预示该区域的氮代谢过程较为活跃。定量结果表明,古菌丰度为2.00×10^7-8.20×10^7copies/g,且随深度增加呈下降趋势。研究结果可为进一步探讨南海沉积物中的古菌群落特征提供依据。

英文摘要:

In this study, Illumina high-throughput sequencing technology and real-time quantitative PCR (RT-qPCR) were used to profile the archaeal community and vertical distribution in the surface, middle and bottom sediments of Pearl River Mouth Basin in the northeastern South China Sea. The results showed that the majority of arehaeal se- quences were classified into Thanmarchaeota, Woesearchaeota, Bathyarchaeota and Euryarchaeota. The archaeal community diversity and richness in the surface sediment were lowest in three samples, in which Marine Group I (MGI) was most abundant; in contrast, the main groups were MGI, Group C3, Marine Benthic Group B and Ther-moplasmata in the middle and bottom sediments. Interestingly, Nitrosopumilus related to ammonia oxidation was dominant in the sediments, suggesting that nitrogen metabolism was probably active. RT-qPCR results illuminated the abundance of archaea ranging from 2.00 × 10^7 copies/g to 8.20× 10^7copies/g decreasing with the increasing depths. These results will provide a basis for further study of the archaeal community characteristics in the sediments of South China Sea.

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期刊信息
  • 《海洋环境科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家海洋局
  • 主办单位:国家海洋局海洋环境保护研究所 国家海洋环境监测中心 中国海洋环境科学学会
  • 主编:关道明
  • 地址:大连市303信箱(沙河口区凌河街42号)
  • 邮编:116023
  • 邮箱:hyhjkx@vip.126.com
  • 电话:0411-84783126
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-6336
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1168/X
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 第二届全国优秀科技期刊三等奖,首届全国环境期刊评比一等奖,2001、2002年度大连市优秀期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13001