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水稻纹枯病菌6-磷酸葡萄糖胺合成酶基因的克隆、测序及表达分析
  • ISSN号:1001-7216
  • 期刊名称:中国水稻科学
  • 时间:2012
  • 页码:137-143
  • 分类:Q755[生物学—分子生物学] S435.111.42[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]江苏省农业科学院植物保护研究所,江苏南京210014, [2]江苏省农业科学院粮食作物研究所,江苏南京210014, [3]南京农业大学植物保护学院,江苏南京210095
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30900929,31071754)
  • 相关项目:抗菌二肽溶杆菌素代谢通路在水稻中构建及其抗病性机理的研究
中文摘要:

为筛选新型水稻纹枯病菌GlmS活性抑制物质,采用3’RACE和5’RACE克隆了水稻纹枯病菌GImS的基因组DNA序列和完整的cDNA序列。GlmS基因组DNA序列全长2529bp,含有8个内含子;GImScDNA序列全长2094bp,推测编码一个含有697个氨基酸残基。分子量约为76.7kD的蛋白质。生物信息学分析表明水稻纹枯病菌GImS含有1个谷氨酰胺氨基转移酶结构域和2个葡萄糖异构酶结构域。采用大肠杆菌重组融合表达GImS,重组蛋白的分子量经过葡聚糖凝胶层析和SDS—PAGE电泳测得分别为306kD和77kD,表明GImS是由4个相同大小亚基组成的多聚酶复合体。重组蛋白的酶学性质研究表明其最适反应温度为37℃,最适pH为6.4,42℃下的半衰期为1h,在pH5.5~7.5时比较稳定。GImS催化反应能被己糖胺通路末端产物鸟苷氮乙酰葡萄糖胺反馈抑制。

英文摘要:

To develop novel antimicrobial agents to Rhizoctonia solani, the genomic gene and complete cDNA encoding glucosamine-6-phosphate synthetase were cloned and sequenced from the rice pathogen Rhizoctonia solani by 3CRACE and 5CRACE . Homologous to other reported GlmS in sequence, the GImS contains eight introns, and encodes a predicted protein of 697 amino acids. Domain structure analysis revealed that R. solani GlmS contained a glutamine transferase motif and two sugar isomerase motifs. Recombinant native R. solani GlmS enzyme was over-expressed using Escherichia coli and purified. The results of Gel filtration chromatography and SDS-PAGE revealed that it had an estimated molecular mass of 306 kD and consisted of four equal-sized subunits of 77 kD. The optimal reaction conditions for the recombinant GImS were pH 6.4 at 37°C, the half-life period for the recombinant GImS was 1 h at 42°C and the enzyme was stable at pH 5. 5-7. 5. R. solani GlmS activity was inhibited by the end-product of the hexosamine pathway, UDP-GlcNAc.

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期刊信息
  • 《中国水稻科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国水稻研究所
  • 主编:程式华
  • 地址:杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
  • 邮编:310006
  • 邮箱:cjrs@263.net
  • 电话:0571-63370278
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7216
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1146/S
  • 邮发代号:32-94
  • 获奖情况:
  • 首届全国科技期刊评比二等奖,第二届全国优秀科技期刊评比三等奖,农业部浙江省优秀期刊,国家期刊奖百种重点期刊,百种中国杰出学术期刊,中国精品科技期刊,中国国际影响力优秀学术期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17826