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灵芝漆酶基因转录Cu^2+诱导特性及其启动子的克隆与序列分析
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:《南京农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.5[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学生命科学学院/农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,江苏南京210095
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30571294,30300006);江苏省自然科学基金创新人才项目(BK2006517)
中文摘要:

以Cu^2+为诱导物检测了灵芝漆酶同工酶基因的转录特性,并对其启动子进行了克隆及序列分析。研究发现:灵芝漆酶基因在Cu^2+的作用下表达量出现明显差异,其中以在发酵液中添加3.0mmol·L^-1 Cu^2+、诱导时间为6d时,漆酶基因的mRNA表达量最高。根据GenBank中已报道的灵芝漆酶基因的序列信息,经PCR扩增获得了灵芝漆酶5’端长879bp的基因特异序列,进而通过self-formed adaptor PCR(SEFA—PCR)方法,扩增得到灵芝漆酶基因起始密码子上游长832bp的启动子序列。分析表明,该启动子区域除分布有TATA—box、CAAT—box及Gc—box等基本的转录起始元件外,还存在多个潜在的顺式作用元件序列位点,包括4个MRE元件、4个STRE元件、11个HSE元件和5个氮因子结合位点等。

英文摘要:

Copper was taken as an inducer to investigate the transcription characteristics of the laccase isozyme gene from Ganoderma lucidum, and the promoter sequence of the laccase gene was amplified from G. lucidum genomic DNA and analyzed. The expression of the laccase gene in the G. lucidum was significantly different under the effects of copper in this study. The expression of mRNA of the laccase gene was the highest after treated by adding 3.0 mmol.L^-1 copper into the liquid medium for 6 days. According to the sequence of the laccase gene of the G. lucidum from GenBank, an 879 bp sequence, which was the 5'terminal sequence of the laccase gene of G. lucidum HG, was obtained. Then an 832 bp promoter sequence on the upstream of the initiation codon in laccase gene of the G. lucidum HG was amplified through a self-formed adaptor PCR (SEFA-PCR) method. The promoter was analyzed using the Softberry software. The result showed that, besides some basic transcription initiation elements, such as TATA-box, CAAT-box and GC-box, some other potential cis-acting element sequence sites also existed, including four MRE, four STRE, eleven HSE and five nitrogen factor binding sites, etc.

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期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558