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氨基酸侧链与氧化鸟嘌呤碱基对体系的氢键作用
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O641[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:辽宁师范大学化学化工学院,大连116029
  • 相关基金:国家自然科学基金(批准号:21133005,21603091)、辽宁省教育厅一般项目(批准号:L2014426)和辽宁师范大学创新实践项目(批准号:cx20170113)资助.
中文摘要:

应用量子化学方法,分别在气相和水溶液中对氨基酸侧链与氧化鸟嘌呤碱基对(8-oxo-G∶C)形成的三体复合物的氢键键能、几何结构、电荷分布及二阶稳定化能进行了研究.结果表明,水溶液的存在削弱了复合物中的氢键强度,电荷分布变化明显,水溶液中形成氢键位点的电荷变化量约为气相中的10倍,而几何结构变化不明显、对于酶与DNA之间的相互作用的研究需在水溶液中进行.水溶液对带电三体复合物中8-oxo-G∶C与氨基酸侧链间的氢键有较大影响,键能平均减小了69.23 k J/mol,不带电复合物仅减小了3.60k J/mol.水溶液中三体复合物中8-oxo-G∶C间的氢键受侧链的影响不大,且与侧链带电与否无关,带电复合物和不带电复合物的氢键强度分别减小了24.57和30.05 k J/mol,且二阶稳定化能越大,其对应的氢键键长越短.

英文摘要:

The hydrogen bond energy, geometry, charge distribution and second order stabilization energy of complexes oxidized base pair ( 8-oxo-G : C ) and Amino acid side chains were investigated via quantum chemistry in gas phase and aqueous solution. The results show that the hydrogen bond strength has been weak- ened in aqueous solution, ,the charge has been obviously affected by aqueous solution, the charge variation of forming hydrogen bond sites under aqueous solution is about 10 times as much as under gas phase and the geometry has slight change. Therefore the interaction between enzyme and DNA must be studied in aqueous solution. The aqueous solution has a great influence on the hydrogen bond strength between 8-oxo-G : C and amino acid side chains in charged complexes, which has been weakened by 69.23 kJ/mol in average. The hydrogen bond strength between 8-oxo-G: C and amino acid side chains in uncharged complexes has only been weak- ened by 3.60 kJ/mol in average. The side chain with or without charge has little effect on the hydrogen bond strength between 8-oxo-G and C in complexes in aqueous solution and the hydrogen bond strengths of charged complexes and uncharged complexes have been weakened by 24. 57 and 30. 05 kJ/mol, respectively. The higher the second-order stabilization energy, the shorter the length of the corresponding hydrogen bonds.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676