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大豆株高QTL的“整合”及Overview分析
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:遗传
  • 时间:2012.10.10
  • 页码:215-224
  • 分类:S511[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]桂林理工大学,桂林541000, [2]中国农业科学院作物科学研究所,国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(编号:31271753)资助
  • 相关项目:矮秆大豆突变体内源赤霉素调控及根系形态特征的研究
中文摘要:

株高是作物株型的重要组成因子,与作物种植密度、抗倒伏性及产量等密切相关。文章利用Soybase数据库和文献报道的201个与大豆株高相关的QTL信息,在物理整合的基础上,采用软件BioMercator2.1进行元分析,得到15个株高的"通用"QTL,分别位于大豆的6号、7号、11号、13号和18号染色体。同时,利用基于统计学原理的Overview方法进行优化,将这些QTL位点的置信区间最小缩至0.1 cM,从而明确了QTL位点在染色体上的遗传位置。对重演性较好的QTL位点所对应的区段内的基因进行分析,初步筛选出可能与株高相关的候选基因17个。文章为大豆株高相关QTL位点的精细定位及分子标记辅助育种奠定了基础。

英文摘要:

Plant height, one of the most important factors for plant architectures, is closely related with some important traits such as plant density, lodging resistance and yields.. In the present study, 201 QTLs related to plant height of soybean from database and references were analyzed. The results revealed that 15 consensus QTLs located on chromosomes 6, 7, 11, 13, and 18 were identified after physical integrations and Meta analysis using the software BioMercator 2.1. Moreover, "Overview" method was used to optimize these QTLs based on statistic analysis. Some of the valid QTL regions were nar-rowed down to the 0.1 cM and mapped on certain chromosomes. Furthermore, the functions of all genes located in these confidence regions were predicted and 17 candidate genes that might be related to plant height were identified. These results would lay a foundation for fine mapping of QTLs related to plant height and marker-assisted breeding in soybean.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270