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植物DNA条形码与生物多样性数据共享平台构建
  • ISSN号:1005-0094
  • 期刊名称:《生物多样性》
  • 时间:0
  • 分类:Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库,昆明650201, [2]中国科学院昆明植物研究所科技信息中心,昆明650201, [3]中国科学院昆明植物研究所资源植物与生物技术重点实验室,昆明650201, [4]中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室,昆明650201
  • 相关基金:科技部科技基础性工作专项项目(2013FY112600); 科技部国家高技术研究发展计划(863计划)主题项目(2012AA021801); 中国科学院大科学装置项目(2009-LSFGBOWS-01)
中文摘要:

DNA条形码基于较短的DNA序列实现物种的快速、准确鉴定,不仅加快了全球生物物种的鉴定和分类步伐,也为生物多样性的管理、保护和可持续利用提供了新思路和研究方法。植物DNA条形码标准数据库的不断完善,将使植物多样性信息的快速获取成为可能;将不同类型数据资源整合、共享和利用,构建植物DNA条形码数据共享平台,是满足公众对物种准确鉴定和快速认知的重要支撑。本文介绍了近年来植物DNA条形码的研究进展;植物DNA条形码参考数据库的研发现状和存在的问题。结合上述问题,围绕"大数据"时代背景,对如何管理和使用好海量的植物信息,如何构建数据共享平台提出了一些设想:(1)数据共享平台的元数据应尽可能翔实、丰富、准确和多关联;(2)数据标准应统一规范;(3)查询入口方便、迅速、多样,易于管理,便于实现更大程度的数据共享和全球化的合作交流。

英文摘要:

DNA barcoding technology provides an opportunity for rapid,accurate,and standardized species-level identification using short DNA sequences.This method speeds up species identification and classification,and presents a new tool for the management,conservation and sustainable development of biodiversity at a global level.Due to improvements in plant barcode database availability and functionality,it is becoming feasible to meet increasing demands for biodiversity information.A framework is needed for a barcoding server platform that utilizes,integrates,and s hares among different data types.Such a platform would be an important step towards enabling the public to rapidly identify species and acquire species-related digital information.In this paper,we review current progress on plant DNA barcoding.Secondly,we summarize the current status of,and identify bottlenecks for,plant DNA barcode reference libraries specifically.Thirdly,in the Big Data era,it is indispensable to manage and make good use of massive amounts of plant information.We provide the following suggestions for the framework of server platform:(1) metadata should be substantial,accurate and correlative;(2) data should be norm alized;(3) query entrance is c onvenient,efficient,easy to manage,and available for l arge-scale data sharing and global communication.

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期刊信息
  • 《生物多样性》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物多样性委员会、中国植物学会、中国科学院植物研究所、中国科学院动物研究所、中国科学院微生物研究所
  • 主编:马克平
  • 地址:北京香山南辛村20号
  • 邮编:100093
  • 邮箱:biodiversity@ibcas.ac.cn
  • 电话:010-62836137
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-0094
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3247/Q
  • 邮发代号:82-858
  • 获奖情况:
  • 2000年获中国科学院优秀期刊三等奖,2006年"中国百种杰出学术期刊"称号,2007年"中国百种杰出学术期刊"称号,2008年度中国精品科技期刊,2008年度"中国科协精品科技期刊工程"B类项目资助,2008年"第六届中国科协期刊优秀学术论文"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南
  • 被引量:19480