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血浆中多基因联合甲基化检测在肺癌诊断中的应用
  • ISSN号:1000-4718
  • 期刊名称:《中国病理生理杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R446.1[医药卫生—诊断学;医药卫生—临床医学] R734.2[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]河北大学生命科学学院生物芯片研究室,河北保定071002, [2]Western University of Health Science, California 91766, USA, [3]河北大学附属医院,河北保定071002
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(No.81272444;No.81472744)
中文摘要:

目的:探究血浆中CDH13、RASSF13A、DLEC13、SEPT13、RUNX13等抑癌基因启动子甲基化及其联合检测在肺癌诊断中的价值。从中选出诊断效能高的组合。方法:采用巢式甲基化特异性PCR(nest methylation specific PCR,n MSP)法,检测106例健康人血浆样本、106例肺癌组织和癌旁组织以及其对应的106例术前血浆样本、中基因启动子区的甲基化状态。对血浆基因组DNA修饰后进行多重置换扩增(multiple displacement amplification,MDA),以解决血浆DNA模板不足的问题。结果:肺癌组织样本中的CDH13、RASSF13A、DLEC13、SEPT13、RUNX13基因启动子甲基化率分别为51.9%、44.3%、54.7%、36.8%、24.5%。对应的血浆样本中的CDH13、RASSF1A、DLEC1、SEPT9、RUNX3基因启动子甲基化率分别为46.2%、41.5%、50.9%、31.1%、19.8%。Kappa一致性检验结果表明肺癌组织与血浆的甲基化检出率一致。CDH13、DLEC1、RASSF1A、SEPT9组合对肺癌的诊断效能明显高于其它组,准确度ACC为82.08%,Youden指数为0.6415(灵敏度为79.49%,特异度为81.13%)。结论:血浆多基因联合甲基化检测有望应用于肺癌早期诊断。

英文摘要:

AIM: To determine the aberrant methylation status in the gene promoter regions of CDH13, RASSFIA, DLEC1, SEPT9 and RUNX3 by detecting the plasma specimens and the value of their combined detection for di- agnosis of lung cancers. METHODS: Nest methylation specific PCR (nMSP) was used to detect the promoter methylation status of the 5 genes in the plasma from 106 normal controls, lung cancer tissues, lung benign tissues and the plasma from 106 patients with lung cancers. Multiple displacement amplification (MDA) was used to amplify modified genomic DNA to solve the problem of insufficient of plasma DNA template. RESULTS: The positive rates of promoter methylation of CDH13, RASSFIA, DLEC1, SEPT9 and RUNX3 in the lung cancer tissues were 51.9%, 44. 3%, 54,7%, 36. 8%, 24. 5%, respectively, and those in the plasma were 46. 2%, 41.5%, 50.9%, 31.1%, 19. 8%, respectively. The re- suits of the Kappa consistency check showed that the lung cancer tissues and the plasma had obviously coherence in the methylation status of the 5 gene promoter regions. Combination of DLEC1, CDH13, RASSF1A, and SEPt9 had a higher di- agnostic efficiency than the others, as their ACC value was 0. 8208 and youden index was 0. 6415 ( with the sensitivity of 81.13% and the specificity of 83.02% ). CONCLUSION: Combination detection of promoter methylation of lung cancer- related genes in the plasma is expected to apply to the early diagnosis of lung cancer.

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期刊信息
  • 《中国病理生理杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国病理生理学会
  • 主编:陆大祥
  • 地址:广东省广州市黄埔大道西601号
  • 邮编:510632
  • 邮箱:obsbjbb@jnu.edu.cn
  • 电话:020-85220269
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4718
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1187/R
  • 邮发代号:46-98
  • 获奖情况:
  • 1997-2000年连续获得中国科协优秀基础性和高科技...,1992、1996、2000、2004、2008年,连续五次入选中...,2008-2010年,连续三年荣获“百种中国杰出学术期...,2010年获广东省期刊最高奖——品牌期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:37010