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来源于Pseudomonas sp.1-7对硝基酚降解基因簇中的对苯二醌还原酶基因的克隆和功能鉴定
  • ISSN号:1008-0864
  • 期刊名称:中国农业科技导报
  • 时间:2012
  • 页码:70-75
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] Q93[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院生物技术研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31170036)资助
  • 相关项目:假单胞杆菌中对硝基酚代谢途径及降解操纵子的表达调控机理研究
中文摘要:

Pseudomonas sp.1-7可以利用对硝基酚(PNP)作为唯一的碳源,氮源和能源生长。为了鉴定菌株1-7代谢PNP的相关基因,本研究构建了菌株1-7基因组的Fosmid文库,并通过文库的筛选克隆得到一段长为12.3 kb的基因簇序列。序列分析显示,该基因簇中共有7个基因(pdcEDGFCBA)与PNP的代谢相关。其中PdcB与来源于Pseudomonas sp.WBC-3中的对苯二醌还原酶(PnpB)有98%的相似性。将pdcB基因在E.coliBL21中过量表达,并通过Ni-NTA亲和层析纯化重组蛋白PdcB。体外的酶活测定表明,PdcB为一个FAD和NADH依赖型的对苯二醌还原酶,能够催化对苯二醌降解并生成对苯二酚。

英文摘要:

Pseudomonas sp. 1-7 utilizes p-nitrophenol (PNP) as a sole source of carbon, nitrogen, and energy. In order to identify the genes involved in this utilization, a gene cluster was identified in a 12.3 kb DNA fragment of a genome fosmid library. Sequence analysis revealed that there were 7 genes (pdcEDGFCBA) related in PNP degradation. PdeB shares 98% identity to the p-benzoquinone reductase (PnpB) from Pseuclomonas sp. WBC-3. The pdcB gene was then over-expressed in E. coli BL21, and the recombinant protein PdcB was further purified with Ni-NTA affinity chromatography. Purified PdcB was shown a FAD and NADPH-dependcnt p-benzoquinone reductase that catalyzed the reduction of p-benzoquinone to hydroqninone by in vitro activity assays.

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期刊信息
  • 《中国农业科技导报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:科学技术部
  • 主办单位:中国农村技术开发中心
  • 主编:范云六
  • 地址:北京市海淀区中关村南大街12号中国农业科学院生物技术研究所
  • 邮编:100081
  • 邮箱:nykjdb@163.com
  • 电话:010-82106118
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0864
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3900/S
  • 邮发代号:82-245
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12485