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结合生物学意义的化学计量学数据处理用于微生物代谢指纹分析
  • ISSN号:1674-1404
  • 期刊名称:大连工业大学学报
  • 时间:0
  • 页码:638-643
  • 语言:中文
  • 分类:O657[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]大连工业大学生物工程学院,辽宁大连116034, [2]大连工业大学现代教育技术部,辽宁大连116034
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(20776029); 辽宁省高等学校优秀人才支持计划项目(2008RC07)
  • 相关项目:基于UPLC-Q-TOF-MS/MS和GC-MS的微生物代谢网络研究
中文摘要:

采用化学计量学方法对气相色谱-质谱联用代谢指纹分析数据进行处理,通过微矩阵显著性分析策略寻找不同碳源条件下6株不同遗传背景大肠杆菌变化最显著代谢物,以所发现的最显著变化的代谢物为中心,分别与同条件下检出的其他代谢物进行相关分析,筛选到相关系数较大的代谢物。不仅发现了在不同培养条件下波动显著性化合物(葡萄糖和果糖为唯一碳源条件下变化最显著代谢物分别为谷氨酰胺和尸胺),并通过聚类分析验证了该数据处理方法的有效性,保证了在大量数据中提取到更加有用的信息。

英文摘要:

As a branch of chemical science,chemometrics is particularly suitable for dealing with a large number of complex data produced by GC-MS.In this study,a method based on metabolic fingerprinting analysis was established.Chemometrics method was used to deal with GC-MS data.As a result,compounds that highly fluctuate in the different culture conditions were discovered,and the validity of the data processing method was proved by cluster analysis,which indicated that the method can be used to extract more useful information from the large amounts of data.

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期刊信息
  • 《大连工业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省教育厅
  • 主办单位:大连工业大学
  • 主编:赵琛
  • 地址:大连市甘井子区轻工苑1号
  • 邮编:116034
  • 邮箱:xuebao@dlpu.edu.cn
  • 电话:0411-86323650
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-1404
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1560/TS
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 2000年获《CAJ-CD规范》执行优秀奖,2001年获大连市优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘
  • 被引量:1820