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鱼类致病鰤鱼诺卡氏菌(Nocardiaseriolae)的LAMP检测技术建立与应用
  • ISSN号:0029-814X
  • 期刊名称:《海洋与湖沼》
  • 时间:0
  • 分类:S941.4[农业科学—水产养殖;农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]“应用海洋生物技术”教育部重点实验室宁波大学生命科学与生物工程学院,宁波315211
  • 相关基金:长江学者和创新团队发展计划资助,IRT0734号;农业部公益性行业科研专项,200903029号;浙江省自然科学基金项目,Y3080244号.
中文摘要:

针对鲫鱼诺卡氏菌16S-23SrRNA基因内转录间隔序列,设计了四条LAMP引物,在外内引物浓度比1:8、dNTP浓度0.8—1.2mmol/L、Mg2.浓度10--14mmol/L、反应温度60—65℃、反应时间60min的优化条件下,扩增产物经电泳后呈现特异性的LAMP梯形条带,建立的LAMP法具有高灵敏度,达到10^-7μg/μlDNA浓度,比常规PCR方法高100倍。将该方法应用于取自养殖场的乌鳢、大黄鱼、黄姑鱼组织样品检测,结果在16份组织样品中有7份检出自然感染的鳓鱼诺卡氏菌,与同步取样品鱼组织的细菌分离、培养检查结果相一致,并显示既能检测发病鱼,又能检出未发病且已感染的病鱼。分析表明,这是一种能快速、简易、特异、敏感的检测鱼类致病鲫鱼诺卡氏菌的诊断方法。

英文摘要:

To develop a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for detection of fish pathogenic Nocardia seriolae. Four primers were designed based on the sequence of the 16S--23S ribosomal RNA internal transcribed spacer region of N. seriolae for the use of LAMP assay. The assay was optimized to the following conditions: 1:8 outer primer concentration ratio, 0.8--1.2mmol/L of dNTP, 10--14mmol/L of Mg2+, at 60--65℃ for 60min. LAMP amplification products had ladder-like bands when electrophoresed on an agarose gel. The assay could amplify up to 10^-7μg/μl of DNA. Hence, the sensitivity of LAMP assay was 100-fold higher than the standard PCR protocol. The assay was applied to detect the presence of Nocardia seriolae in different tissue samples from farm Ophiocephalus argus, Pseudnoseiaena crotea, Niber albiflora. Seven naturally infected 17. seriolae were detected in 16 tissue samples, and the results from the bacterial culture test were consistent with fish tissue samples taken simultaneously. This study showed LAMP assay could be used not only to diagnose the infected fishes, but also to recognize the carrier ofN. seriolae as well. LAMP assay is a rapid, simple, specific and sensitive test to diagnose for fish pathogenic N. seriolae.

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期刊信息
  • 《海洋与湖沼》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国海洋湖沼学会
  • 主编:孙松
  • 地址:青岛市南海路7号中科院海洋所内
  • 邮编:266071
  • 邮箱:
  • 电话:0532-82898753
  • 国际标准刊号:ISSN:0029-814X
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1149/P
  • 邮发代号:2-421
  • 获奖情况:
  • 2000年中国科学院优秀期刊一等奖,2000年山东省科委、新闻出版黑署评估优秀级,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21021