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p53 DNA结合域与抗癌多肽的拉伸分子动力学研究
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q6[生物学—生物物理学] Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京100124, [2]燕山大学理学院,秦皇岛066004, [3]Biophysics and Nanoscience Center, Deportment of Ecology and Biology (DEB), University of Tuscia, 01100 Vitcrbo, Italy
  • 相关基金:This work was supported by grants from International S&T Cooperation Program of China (2010DFA31710), The National Natural Science Foundation of China (11204267), The doctoral fund of innovation from Beijing University of Technology and by a grant from The Ralian Association for Cancer Research (AIRC No IG 10412).
中文摘要:

研究发现,取自蓝铜蛋白azurin的一段多肽p28能够进入癌细胞,结合到肿瘤抑制因子p53的DNA结合域上,进而增加p53的抗癌能力.本工作中,通过拉伸分子动力学方法,在原子尺度上研究了p28-p53 DBD复合物的解离过程.分析结果显示复合物的解离过程遵循着一定的分离顺序.对解离力的分析以及对沿着解离路径的不可逆做功的计算,使我们能够从复合物的能量地貌中提取有用的信息,而这些信息也决定了复合物的解离过程.

英文摘要:

The p28 peptide, derived from the blue copper protein azurin, is known to enhance the anticancer capabilities of the tumor suppressor p53 likely binding to its DNA-binding domain (DBD). The p28-p53 DBD complex has been investigated by steered molecular dynamics in order to characterize the unbinding process at atomic resolution. We found that the unbinding of the complex follows a candidate pathway with a well-defined detaching sequence between the partners. The analysis of the unbinding force and the calculation of the irreversible work done along several unbinding paths have allowed us to extract information on the energy landscape regulating the unbinding process.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18821