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鸭坦布苏病毒SYBR GreenI实时荧光定量检测方法的建立
  • ISSN号:1005-4545
  • 期刊名称:《中国兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.657[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心,福建福州350013
  • 相关基金:现代农业产业体系建设专项资金资助项目(CARS-43);公益性行业(农业)科研专项(201003012);福建省种业创新与产业化工程项目(FJZYCX-9);公益类科研院所专项(2011R1025-8);福建省自然科学基金资助项目(2012J001112);福建省农业科学院创新团队项目(STIF-Y02)
中文摘要:

根据鸭坦布苏病毒(DuckTembusuvirus,DFV)NS5基因序列特征设计引物,建立基于SYBRGreenI检测模式的实时荧光定量RT—PCR(real—timeRT—PCR。RRT—PCR),该方法检测DFVNS5基因2.74×10。~2.74×10’拷贝/肛L反应范围内有很好的线性关系。扩增产物的熔解曲线分析只出现1个单特异峰,无引物二聚体,丁m值为(86.23士0.18)。C,对禽流感病毒、鸭肝炎病毒、鸭源禽1型副黏病毒、鸭减蛋综合征病毒、番鸭呼肠孤病毒核酸均无阳性信号扩增,可重复性好,组内变异系数为0.52%~1.48%,组间变异系数0.71%~2.21%。检测速度快,从样本处理到报告结果仅需4h。

英文摘要:

A pair of specific primers targeted to non structure gene 5 (NSS) of duck Tembusu virus was designed and a SYBR Green I fluorescent based real-time RT-PCR (RRT-PCR) was devel- oped for the quantization of duck Tembusu virus. The detection limit of RRT-PCR was 2.74 × 102 plasmid copies. The melting curve analysis using SYBR Green I dye showed one specific peak, a melting temperature (Tm) was (86.23±0.18) ℃ ,and no primer-dimers peak was observed. No amplification was detected from unrelated virus samples by this method, such as avian influenza virus, duck hepatitis virus type 1, avian paramyxovirus type 1, egg drop syndrome virus, duck reo- virus. Fine reproducibility was obtained for detecting plasmid DNA with intra-assay of 0. 52%- 1.48G and inter-assay of 0.71G-2.21G. The real-time PCR method developed in this study will be useful for rapid laboratory diagnosis and epidemiology investigation for duck Tembusu virus.

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期刊信息
  • 《中国兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学
  • 主编:王哲
  • 地址:吉林省长春市西安大路5333号
  • 邮编:130062
  • 邮箱:xbcjvs@163.com
  • 电话:0431-87836531 87836534
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-4545
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1234/R
  • 邮发代号:12-105
  • 获奖情况:
  • 第二届全国优秀科技期刊评比二等奖,连续多次被评为全军优秀医学期刊一等奖,全国高校优秀自然科学学报评比一等奖,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18973