以非平衡势力学分离理论为框架,建立了毛细管电泳分离大系统的分离模型,以分离过程的操作电压U为控制量,以溶质体系的净分离熵SS作为目标函数。通过对分离大系统的优化设计,得到了最优操作电压控制轨线U^*(t),通过仿真,证明了分离大系统在此最优控制规律作用下,分离效果最好。