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甜菜M14品系特异表达基因ESTs的生物信息学分析
  • ISSN号:1001-7011
  • 期刊名称:《黑龙江大学自然科学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S566.3[农业科学—作物学] S188[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]黑龙江大学生命科学学院分子生物学重点实验室,哈尔滨150080
  • 相关基金:国家863计划项目(863-101-04-01-07);国家转基因科研计划项目(G99-A-014);黑龙江省自然科学基金重点项目(ZJN-03-6);黑龙江大学实验室开放项目
中文摘要:

甜菜M14品系具有无融合生殖特性,为了获得M14品系特异表达的基因,本实验室前期利用抑制消减杂交(SSH)和mRNA差异显示(DDRT-PCR)技术对M14品系和能够进行有性生殖的栽培甜菜A2Y品系进行了基因特异表达研究,获得了298条M14品系特异表达基因的ES-Ts。对这些ESTs进行生物信息学分析并进行了GO分类,筛选出5条可能与基因表达调控和细胞周期调控相关的ESTs,为进一步获得这些基因的全长序列并研究其功能奠定了基础,也为今后能在甜菜M14品系中寻找并克隆与无融合生殖相关的基因提供了可靠的保证。

英文摘要:

M14 is a monosomic addition line with the characteristic of apomixis. By using the methods of suppression subtractive hybridization ( SSH ) and mRNA differential display reverse transcriptional PCR ( DDRT - PCR) between M14 and A2Y, 298 ESTs of specially expressed genes of M14 were obtained and the relevant bioinformatics analysis was made. Then, they were annotated and classified by GO ( Gene ontology) method, 5 ESTs whose function were closely related to regulation of gene expression and cell cycle. The research is the basis for obtaining full - length cDNA of these ESTs and characterizing their protein functions in the further study.

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期刊信息
  • 《黑龙江大学自然科学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:黑龙江省教育厅
  • 主办单位:黑龙江大学
  • 主编:霍丽华
  • 地址:哈尔滨市学府路74号
  • 邮编:150080
  • 邮箱:hdxb@vip.sohu.com
  • 电话:0451-86608818
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7011
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1181/N
  • 邮发代号:14-114
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4204