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冰川表层雪样中微生物总DNA几种提取方法的比较研究
  • ISSN号:1000-0240
  • 期刊名称:冰川冻土
  • 时间:0
  • 页码:478-484
  • 分类:Q93-33[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院寒区旱区环境与工程研究所冰冻圈科学国家重点实验室,甘肃兰州730000, [2]南京大学地理与海洋科学学院,江苏南京210093, [3]商丘师范学院生命科学系,河南商丘476000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(40825017;40576001;31100369)资助
  • 相关项目:极地冰川学
中文摘要:

通过对4种具有不同裂解方式的微生物总DNA提取方法的比较,筛选出较佳的方法进行滤膜处理、DNA抽提及沉淀的优化,再将优化出的传统DNA提取方法与商业化试剂盒提取方法比较.结果表明:商业化试剂盒提取总DNA的方法适用于冰川表层雪微生物总DNA的提取;其次,将滤膜剪碎,用溶菌酶(5mg.mL-1)+蛋白酶K(1mg.mL-1)+CTAB(1%)+SDS(1%)的裂解方式,氯仿:异戊醇(24∶1)抽提一次,乙醇沉淀DNA的提取方法是一种效果较佳且廉价的冰川表层雪微生物总DNA提取方法.

英文摘要:

A better method was screened out through comparison of the four methods for total DNA extraction of microorganisms with different lysis.The method screened out was used to optimize the experiments of treating filter membrane,DNA extraction and precipitation.Finally,the optimized method was compared with commercial kit for total DNA extraction of microorganisms.The results showed that the commercial kit was fit for total DNA extraction of microorganisms in surface snow on glacier,and another method with cutting the filter membrane into pieces,lysis(lysozyme(5 mg·mL-1) + proteaseK(1 mg·mL-1) +CTAB(1%)+SDS(1%)),extraction once by chloroform-isoamylalcohol(24∶1) and DNA precipitation by ethanol,was an effective and low-cost method for total DNA extraction of microorganisms in surface snow on glacier.

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期刊信息
  • 《冰川冻土》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院 寒区旱区环境与工程研究所
  • 主办单位:中国地理学会 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所
  • 主编:程国栋
  • 地址:兰州市天水中路8号
  • 邮编:730000
  • 邮箱:edjgg@lzb.ac.cn
  • 电话:0931-8260767
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-0240
  • 国内统一刊号:ISSN:62-1072/P
  • 邮发代号:54-29
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,第二届全国优秀地理期刊,甘肃省优秀地理期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国地质文献预评数据库,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17974