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用分子对接搭建激酶-抑制剂复合物的三维结构
  • ISSN号:0465-7942
  • 期刊名称:《南开大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q615[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]南开大学分子生物学研究所,天津300071, [2]南开大学生物活性材料教育部重点实验室,天津300071
  • 相关基金:国家863项目(2006AA020502);国家自然科学基金(30670080)
中文摘要:

由于蛋白激酶的异常激活导致了许多疾病,激酶抑制剂成为当今医药领域的研究热点。鉴于分子对接在药物设计中取得的成功,该技术被应用于激酶抑制剂的设计。应用分子对接软件包Autodock4对已知三维结构的激酶抑制剂复合物进行模拟对接,对接所得抑制剂构象与晶体结构非常一致。进一步利用对应激酶在其他体系中的结构与抑制剂进行对接,也获得了与晶体结构一致的抑制剂构象,再现了抑制剂和蛋白间重要的相互作用,从而阐明了利用Autodock4探索激酶-抑制剂结合模式的可行性。

英文摘要:

A number of diseases are linked to overactivation of protein kinases and a lot of kinase inhibitors have been developed. Considering that docking method achieved great success in drug design, we applied it to kinase inhibitors design from structure. Autodoek4 was used to dock a group of inhibitors to kinase proteins. Both proteins from complex structures and lig- and-free proteins were used as targets. The docked conformations well reproduced the crystallographic structures. It is concluded that Autodock4 can be used to explore binding mode of protein kinase inhibitors.

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期刊信息
  • 《南开大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:南开大学
  • 主编:田建国
  • 地址:天津南开区卫津路94号
  • 邮编:300071
  • 邮箱:
  • 电话:022-23501681
  • 国际标准刊号:ISSN:0465-7942
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1105/N
  • 邮发代号:6-174
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),德国数学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:4822