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HCSGD:An integrated database of human cellular senescence genes
  • ISSN号:1673-8527
  • 期刊名称:《遗传学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] Q255[生物学—细胞生物学]
  • 作者机构:[1]Ministry of Education Key Laboratory of Bioinformatics, Center for Synthetic and Systems Biology, Department of Automation, Tsinghua University, Beijing100084, China, [2]Bioinformatics Division, Tsinghua National Laboratory for Information Science and Technology, Beijing 100084, China, [3]Department of Basic Medical Sciences, School of Medicine, Tsinghua University, Beijing 100084, China
  • 相关基金:supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31371341);Tsinghua University Initiative Scientific Research Program(No.20141081175);the Open Research Fund of State Key Laboratory of Bioelectronics,Southeast University
中文摘要:

细胞的老朽是响应象 telomere 机能障碍和 DNA 损坏一样的各种各样的外长、内长的刺激的一个不可逆的房间周期拘捕节目。它广泛地作为一个反肿瘤节目被接受了并且也与胚胎开发,织物修理, organismal 老化和年龄相关的退化疾病有关仔细被发现。在过去的十年,众多的努力被作了揭开基因细胞的老朽的规章的机制。有一个强壮的要求从各种各样的资源把这些数据集成到一个开的平台。在细胞的老朽上便于研究人员,我们由把多重在网上出版的数据来源集成到一个全面老朽基因注解平台(http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/member/xwwang/HCSGD ) 开发了人的细胞的老朽基因数据库(HCSGD ) 。潜在的人的细胞的老朽基因(HCSGS ) 被从出版文学,基因表示介绍数据和蛋白质蛋白质相互作用网络联合信息收集。另外,基因与基因本体论注解和 microRNA/drug/compound 目标信息被注解。HCSGD 提供一个珍贵资源设想细胞的老朽基因网络,浏览注解功能的信息,并且检索有一个用户友好的网接口的联系老朽的基因。

英文摘要:

Cellular senescence is an irreversible cell cycle arrest program in response to various exogenous and endogenous stimuli like telomere dysfunction and DNA damage.It has been widely accepted as an antitumor program and is also found closely related to embryo development,tissue repair,organismal aging and age-related degenerative diseases.In the past decades,numerous efforts have been made to uncover the gene regulatory mechanisms of cellular senescence.There is a strong demand to integrate these data from various resources into one open platform.To facilitate researchers on cellular senescence,we have developed Human Cellular Senescence Gene Database(HCSGD) by integrating multiple online published data sources into a comprehensive senescence gene annotation platform(http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/member/xwwang/HCSGD).Potential Human Cellular Senescence Genes(HCSGS)were collected by combining information from published literatures,gene expression profiling data and Protein-Protein Interaction networks.Additionally,genes are annotated with gene ontology annotation and microRNA/drug/compound target information.HCSGD provides a valuable resource to visualize cellular senescence gene networks,browse annotated functional information,and retrieve senescenceassociated genes with a user-friendly web interface.

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期刊信息
  • 《遗传学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院遗传与发育生物学研究所 中国遗传学会
  • 主编:薛勇彪
  • 地址:北京市安定门外大屯路中科院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:ycxb@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-8527
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5450/R
  • 邮发代号:2-819
  • 获奖情况:
  • 1996年获中科院优秀期刊二等奖,1997年获全国优秀期刊三等奖,200年获中科院优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17519