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利用微卫星标记对文蛤4个壳色花纹品系的遗传分析
  • ISSN号:1000-0615
  • 期刊名称:水产学报
  • 时间:0
  • 页码:202-209
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学] S917[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100, [2]中国海洋大学水产学院,山东青岛266003, [3]上海海洋大学水产与生命学院,上海201306
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30972255,31101895); 浙江省自然科学基金(Y3110080)
  • 相关项目:我国文蛤属物种系统分类的再认识及种质资源状况的研究
中文摘要:

利用9个微卫星位点对文蛤红壳(RS)、黑斑(BS)、细纹(TC)、暗纹(DF)4个壳色花纹品系共120个个体进行遗传差异分析。结果共检测到105个等位基因,每个位点平均观察等位基因数为11.7个,其中WG07位点等位基因数最多(21个),WG11位点最少(7个)。每个品系均具有特异等位基因类型,不同品系中相同微卫星位点的等位基因分布规律不同。4个文蛤品系的观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量变异范围分别为0.110~1.000、0.486~0.867、0.433~0.834,均属高度多态性位点。Hardy-Weinberg平衡的卡方检测发现,大多数位点偏离平衡状态;聚类分析表明,4个品系间存在较明显的遗传差异,TC品系与其它品系的遗传距离最大,DF品系和RS品系的遗传距离相对较小。

英文摘要:

Genetic variation of four strains of Meretrix meretrix,thin checkered(TC),black spot(BS),dark fringe(DF)and red shell(RS)was studied.Thirty randomly selected individuals from each strain and nine polymorphic microsatellite loci were used for genetic analysis.A total of 105 alleles were identified,the most alleles were 21(WG07)and the least locus were 7(WG11).The distribution of the alleles for the same loci was different in different strains and specific allele types were detected in each strains.All the microsatellites were highly polymorphic,and various genetic variability measures,including observed heterozygosity(0.486 to 0.867),expected heterozygosity(0.110 to 1.000),and polymorphism information content(0.433 to 0.834),Chi-square tests showed that most of the cases in four strains deviated from Hardy-Weinberg equilibrium.Pairwise FST ranged from 0.005 to 0.269.Genetic distances among strains ranged from 0.052 0 to 0.098 0.The results of cluster analysis indicated that TC strain had higher genetic difference than other strains,then was BS strain,and the genetic variation between DF and RS strains was relatively lower.

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期刊信息
  • 《水产学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国水产学会
  • 主编:黄硕琳
  • 地址:上海市军工路334号上海水产大学
  • 邮编:201306
  • 邮箱:jfc@shou.edu.cn
  • 电话:021-61900228
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-0615
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1283/S
  • 邮发代号:4-297
  • 获奖情况:
  • 曾先后三次获中国科协专项基金资助,获首届《CAJ-CD规范》执行优秀奖,获水产类期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:26128