为研究准噶尔雅罗鱼的遗传多样性,对ISSR-PCR的反应条件进行了优化和适合引物的筛选,采用正交设计方法,选用L9(34)正交表,以准噶尔雅罗鱼的基因组DNA为模板,对影响PCR反应较大的4个因素:Taq酶、Mg2+、dNTPs、引物在3个水平上进行优化试验,得到准噶尔雅罗鱼最优ISSR-PCR反应体系:25μL反应体系中含有1×PCR buffer、0.5 UTaq酶、3.0 mmol/LMgC l2、250μmol/L dNTPs、0.75μmol/L引物、DNA模板30 ng。利用优化体系从32条引物中筛选得到13条适用引物,并确定了各引物最佳退火温度。