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从苹果属腊叶标本中提取DNA的改良CTAB法研究
  • ISSN号:1000-6850
  • 期刊名称:中国农学通报
  • 时间:2012
  • 页码:176-179
  • 分类:Q946.2[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]南京林业大学森林资源与保护学院,南京210037, [2]聊城大学生命科学学院,山东聊城252059
  • 相关基金:国家自然科学基金项目“苹果属(蔷薇科)植物杂交起源研究”(31070619);国家自然科学基金项目“苹果属(蔷薇科)植物分类修订”(31170178); 山东省自然科学基金项目“中国野生苹果砧木资源遗传多样性及嫁接亲和性差异的分子机理研究”(ZR2011CM045)
  • 相关项目:苹果属(蔷薇科)植物杂交起源研究
中文摘要:

为了探求从保存年代较长,并富含多糖多酚的苹果属植物腊叶标本中提取基因组DNA的方法,在传统CTAB法的基础上加以改良,无液氮研磨材料后加入预冷CTAB free缓冲液和提高沉淀时盐浓度,所得模板直接用于扩增nrITS区和cpDNA matK基因。经紫外分光光度和琼脂糖凝胶电泳检测,结果表明用改良方法提取的DNA在质量和产量上优于常规方法并能满足后续扩增反应的要求。该方法不需要液氮研磨,节省了人力和成本,提前加入除杂缓冲液对去除多酚的效果良好,增加沉淀时盐的浓度能有效去除多糖,表明改良CTAB法适合苹果属腊叶标本叶片总DNA的提取。

英文摘要:

In order to find methods for total DNA extraction from Malus herbarium specimens stored for many years and enriching polysaccharides and polyphenolics, modified CTAB methods were studied based on the conventional methods. The DNA templates were used directly in amplifying the whole nrITS region and cpDNA matK gene by adding precooling CTAB free buffer after treated without liquid nitrogen and improving the concentration of NaCl when precipitating. Utraviolet spectrophotometer and agarose gel electrophoresis methods were used to test the DNA quality. The results showed that modified CTAB methods were optimal to produce high quality and yields DNA and amplifiable in the polymerase chain reaction (PCR). This methods don’t need to grind with liquid nitrogen, saving manpower and reducing cost. In addition, adding CTAB freed buffer and improved NaCl when precipitating were effective for the removement of polyphenolics and polysaccharides. The researches indicated that the modified CTAB was suitable for extracting genomic DNA from Malus herbarium leaves.

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期刊信息
  • 《中国农学通报》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国农学会
  • 主编:石元春
  • 地址:北京市朝阳区麦子店街22号中国农学期刊处
  • 邮编:100025
  • 邮箱:edit@agri.org.cn
  • 电话:010-59194480
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6850
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1984/S
  • 邮发代号:2-772
  • 获奖情况:
  • 全国农业核心期刊,中国科协优秀学术期刊,全国农业学会优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:94571