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实时荧光定量PCR检测猪源Mx1方法的建立及应用
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:南京农业大学学报
  • 时间:0
  • 页码:-
  • 分类:S854.43[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏南京210095
  • 相关基金:国家自然科学基金青年基金项目(31001062); 江苏高校优势学科建设工程资助项目
  • 相关项目:猪源Mx1蛋白抑制猪瘟病毒增殖的分子机制研究
作者: 周斌|
中文摘要:

根据GenBank中的猪源抗病毒蛋白Mx1基因(poMx1)序列设计1对特异性引物,从Mx1基因全长片段中扩增和克隆了特异性的115 bp核苷酸片段。测序鉴定正确后将重组质粒进行定量并10倍倍比稀释作为扩增模板,通过SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,建立Mx1的标准曲线及回归方程。结果显示:该标准曲线的回归方程为Y=-2.986 3 lg X+38.239 3(R2=0.998 5),灵敏度为1×102μL-1;应用该方法对猪瘟兔化弱毒苗接种猪肾细胞(PK-15)后产生的poMx1 mRNA进行定量分析,发现病毒感染细胞4 h后,poMx1的表达量最高(P〈0.01),然后随着时间的增加而缓慢减少。结论:建立的SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR方法可以检测poMx1 mRNA的表达水平。

英文摘要:

On the basis of the nucleotide sequences of porcine Mx1 gene(poMx1)available in GenBank,a pair of primers was designed and synthesized to amplify a specific 115 bp nucleotide fragment from Mx1 full-length gene.Then,the SYBR Green Ⅰ real-time PCR assay was established based on 10-fold dilution recombinant plasmid as the amplification template after it was cloned and sequenced.The results showed that the standard curve regression equation was Y=-2.986 3 lg X+38.239 3(R2=0.998 5),and that the standard curve was of high linearity,specificity,sensitivity and reproducibility.The production of poMx1 mRNA from virus-infected cells was quantitatively analyzed after swine kidney cells(PK-15)was stimulated by classical swine fever virus(HCLV strain).The data showed the production of poMx1 mRNA was much more after 4 h(P0.01),and then slowly reduced as time grew.So the results showed that this PCR assay could be applied to detect the expression level of poMx1 mRNA.

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期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558