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中药方剂药物配伍网络构建程序的并行化实现及其应用
  • ISSN号:1673-7571
  • 期刊名称:《中国数字医学》
  • 时间:0
  • 分类:R952[医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]中国中医科学院中医药信息研究所,北京市东直门内南小街16号100700, [2]中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心,北京市海淀区中关村南四街4号100190, [3]北京交通大学计算机与信息技术学院,北京市海淀区上园村3号100044, [4]军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所,北京市海淀区太平路27号100850
  • 相关基金:“十一五”国家高技术研究发展计划(863计划)(编号:2006AA01A122)
中文摘要:

介绍了中药方剂药物配伍网络构建程序使用MPI实现并行化的方法,以及该并行程序在曙光TC2600系统下运行和测试的情况。测试结果显示,使用并行计算的方法在高性能计算环境下可以有效地处理在普通机器上无法处理的较大数量的数据和较为复杂的计算问题。当数据量较大时,采用数据分割的方法进行MPI并行编程是一种行之有效的并行方法。在数据量较大的情况下使用较多数量的CPU参与并行可以明显地提高计算速度。测试结果显示,并行计算的方法和高性能计算技术可以应用于中医药数据挖掘领域,并且可以显著地提高该领域的研究水平。

英文摘要:

With the data partition based on MPI, the parallel algorithm program of the traditional Chinese medicine herb combination network construction transplants successfully to the High Performance Computer environment- Dawning Tc2600.The test shows the method of data partition is effective especially when the quantity of data and the amounts of CPU are increasing. The parallel algorithm and HPC have good application foreground in the field of the traditional Chinese Medicine.

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期刊信息
  • 《中国数字医学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生部
  • 主办单位:卫生部医院管理研究所
  • 主编:李包罗
  • 地址:北京市朝阳区光华路甲8号和乔大厦A座528A室
  • 邮编:100026
  • 邮箱:digmedyiliao@163.com
  • 电话:010-65815163 82327388
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-7571
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5550/R
  • 邮发代号:80-133
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:7274