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Xenopus tropicalis免疫球蛋白轻链重组多样性的研究
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193, [2]中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,北京100194
  • 相关基金:国家杰出青年科学基金(30725029)和国家自然科学基金(30671497)资助项目
中文摘要:

热带爪蟾(Xenopus tropicalis)是两栖类动物免疫球蛋白研究中常用的模式生物之一,其免疫球蛋白轻链的类型和基因结构已经研究清楚,3种轻链类型分别为:ρ、σ和typeⅢ.通过克隆测序,并对3种轻链重组cDNA克隆的VJ基因片段的连接方式进行了分析,发现在表达的3种轻链中,仅有少量的N和P核苷酸的插入.σ轻链基因的体细胞VJ重组主要依靠微同源重组.而在ρ和typeⅢ轻链中这种方式不是主要的,ρ和typeⅢ轻链或是通过VJ基因片段的直接连接或是部分删除后连接.研究结果为研究免疫球蛋白轻链多样性产生的机制提供了重要的线索.

英文摘要:

Xenopus tropicalis is an important model animal in immunology.Based on the available genome data,the genomic organization of all three light chain gene(ρ,σand typeⅢ) loci were recently characterized in Xenopus tropicalis.On the basis of similarity of protein sequences,genomic organization and chromosomal location of the light chain genes among frogs and mammals,the data strongly support the previous suggestions that theρgenes belong to theκgene lineage,whereas the typeⅢgenes share a common origin with theλgenes.About 200 cDNA fragments from each ofρ,σand typeⅢgenes,were cloned and sequenced respectively generating 22,25 and 44 clones that have unique VJ junctions(after removal of redundant clones) .Recombined VJ junctions of cloned light chain cDNA were analyzed,which showed a paucity of N and P nucleotides in expressedρ,σand typeⅢgenes.They also show that somatic VJ rearrangements of theσgene seemed to be dependent on short stretches of homologous nucleotides(microhomology) .The microhomology-directed VJ recombination obviously results in very limited diversity.However,most expressedρand typeⅢVJ junctions showed direct ligation or deletions of V and J coding ends.These results help researchers to understand the generation of Ig diversity in X.tropicalis.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18821