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海洋灰绿曲霉聚酮合酶基因的克隆与序列分析
  • ISSN号:1006-3080
  • 期刊名称:《华东理工大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q936[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]华东理工大学生物工程学院,生物反应器工程国家重点实验室,上海200237
  • 相关基金:国家自然科学基金(41306121,31270141);国家863计划(2011AA090702)
中文摘要:

为了研究海洋灰绿曲霉中抗肿瘤聚酮化合物灰绿霉素A的生物合成机制,需获得相关的聚酮合酶基因簇。根据灰绿霉素A合成途径推断,该化合物母核由非还原型PKS(NR-pKS)催化合成,本文使用LC系列简并引物得到灰绿曲霉中NR—PKS基因片段,再通过基因走读技术得到22.8kb的DNA序列,其含有7个完整的开放阅读框。通过BLAST分析,序列中包含1个NR—PKS编码基因,全长8451bp,命名为Agpks1。AgPks1与烟曲霉PksP、黑曲霉Alb1有很高的同源性。该工作对研究Agpks1对灰绿霉素A或其他聚酮产物合成的催化机制具有重要意义。

英文摘要:

It is critical to identify the polyketide synthase (PKS) gene cluster to clarify the biosynthetic mechanism of antitumor polyketide aspergiolide A, which was deduced to be catalyzed non-reduced PKS (NR-PKS) from marine Aspergillus glaucus. In this study, a NR-PKS nucleotide sequence was first obtained using the LC primers. A full sequence of its gene clusters (22.8 kb) was harvested by genome walking, which contains 70RFs by BLAST analysis. Among them, a NR-PKS gene with full length of 8 451 bp was identified by BLAST and designated as Agpksl. The AgPksl showed high homology to Aspergillus furnigatus PksP and Aspergillus niger Albl. This work provides enlightenment for analyzing the functions of Agpksl in biosynthetic mechanism of aspergiolide A or other polyketides produced by Aspergillus glaucus.

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期刊信息
  • 《华东理工大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:华东理工大学
  • 主编:刘红来
  • 地址:上海梅陇路130号
  • 邮编:200237
  • 邮箱:ecustxbbzz@ecust.edu.cn
  • 电话:021-64252666
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-3080
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1691/TQ
  • 邮发代号:4-382
  • 获奖情况:
  • 2001年被国家新闻出版总署评为"中国期刊方阵科技...,2002年获"第五届全国石油和化工行业优秀期刊二等奖",2004年获"全国高校优秀科技期刊二等奖",2006年荣获"首届中国高校优秀科技期刊奖"以及"第...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:10083