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慈竹LEAFY基因和启动子的克隆及序列分析
  • ISSN号:1000-6567
  • 期刊名称:竹子研究汇刊
  • 时间:2014
  • 页码:16-24
  • 分类:S795.5[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]西南林业大学园林学院
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31060042);国家自然科学基金项目(31160177)
  • 相关项目:竹类植物FLORICAULA/LEAFY同源基因结构、表达模式及其分子进化研究
中文摘要:

研究以开花慈竹叶片为材料,采用RT-PCR、染色体步移和RACE相结合的方法克隆得到慈竹LFY基因的完整片段,该基因DNA全长为3 116 bp,包含5’UTR和3’UTR,3个外显子和2个内含子序列,有一个1 161 bp的完整开放阅读框,编码386个氨基酸,LFY蛋白相对分子质量为42.29 kDa,等电点为8.85。蛋白质二级结构预测发现α-螺旋结构和无规卷曲为主导。通过Tail-PCR技术克隆得到1 003 bp的慈竹LFY基因的启动子序列,包含花粉特异表达元件、种子特异表达元件、激活StDof1蛋白在保卫细胞特异表达元件、控制大豆胁迫下的应答元件MYC识别位点、光调节相关元件及AGL15结合位点保守元件等。利用MAGA5.1软件构建慈竹与44种已知的不同植物来源的LFY基因氨基酸序列的系统发育树,结果显示系统发育树中分为2个大的分支,其中裸子植物和蕨类植物遗传距离较近,禾本科植物中慈竹与玉米遗传距离较近,其次为小麦。该研究从慈竹中克隆得到与花分生组织形式相关基因LFY基因,该研究为今后从分子水平上研究竹类植物开花机理打下基础。

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期刊信息
  • 《竹子学报》
  • 主管单位:浙江省科技厅
  • 主办单位:国家林业局竹子研究开发中心 中国林学会竹子分会 浙江省林业科学研究院
  • 主编:王玉魁
  • 地址:杭州市文一路310号
  • 邮编:310012
  • 邮箱:zzxbbjb@126.com
  • 电话:0571-88869017
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6567
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1399/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1