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土壤宏基因组中硫氧还蛋白还原酶部分序列的克隆
  • ISSN号:1000-2286
  • 期刊名称:《江西农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S481.8[农业科学—农药学;农业科学—植物保护] X172[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]天然源农药与生物化学教育部重点实验室,华南农业大学昆虫毒理研究室,广东广州510642
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30871660); 广东省博士启动基金项目(9451064201003679)
中文摘要:

为探明硫氧还蛋白还原酶(TrxR)在微生物中的保守性,利用宏基因组技术从农药厂废水淤泥中提取环境DNA,并以其为模板直接采用PCR方法进行TrxR基因克隆,最终获得了硫氧还蛋白还原酶基因的部分序列片段。该片段全长476 bp,通过多序列比对及进化树分析,发现其与海杆菌、假单胞菌硫氧还蛋白还原酶基因序列的同源性高达80%以上,氨基酸序列同源性达98%以上,在进化中具有高度的保守性。

英文摘要:

To prove whether thioredoxin reductase(TrxR) is conservative in the microorganisms, metagenomic technique was used for extraction of the soil metagenomic DNA and cloning of TrxR gene from soil metagenomic DNA by PCR technique in this study.Partial TrxR gene with 476 bp was obteined and analysed by multiple sequence comparison and phylogenetic tree analysis.The results showed that it was more than 80%in homology with TrxR genes from Marine bacterium and Pseudomonas,and more than 98%in amio acid homologous alignments.This shows that TrxR has a high degree of conservativeness in the evolution of microorganisms.

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期刊信息
  • 《江西农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江西农业大学
  • 主办单位:江西农业大学
  • 主编:石庆华
  • 地址:江西省南昌市经开区志敏大道1101号江西农业大学期刊社
  • 邮编:330045
  • 邮箱:ndxb7775@sina.com
  • 电话:0791-83813246 83828010
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2286
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1028/S
  • 邮发代号:44-102
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵双百期刊,国家期刊奖百种重点期刊,中国高校精品科技期刊,华东地区优秀期刊,江西省"名刊建设工程"期刊,江西省优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:20807