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柞蚕核多角体病毒lef-12基因序列及转录分析
  • ISSN号:0257-4799
  • 期刊名称:《蚕业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S885.1[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]西南大学农业部蚕桑学重点开放实验室,重庆400716, [2]沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划“973”项目(编号2005CB12-1000),国家自然科学基金项日(编号30771630).
中文摘要:

为加强柞蚕核多角体病毒 (Altthraea pernyi nucleopolyhedrovirus, ApNPV )的分子基础研究,对ApNPV lef-12基因进行序列及转录分析。ApNPV lef-12基因长516个核苷酸,编码171个氨基酸,预测分子质量19.0kD。ApNPV lef-12基因5′端非编码区含有杆状病毒晚期基因启动子模序(ATAAG),但终止密码子(TAG)下游没有典型的多聚腺苷酸信号(AATAAA)。PSI-BLAST表明18种鳞翅目NPV编码ApNPV LEF-12同源蛋白:ApNPV LEF-12蛋白与类群INPV LEF-12的氨基酸一致性高于其与类群ⅡNPV LEF-12的氨基酸一致性。ApNPV LEF-12蛋白及与其关系较近的同源蛋白的有效密码子数较低。转录分析表明,ApNPV lef-12基因属晚期表达基因。

英文摘要:

Antheraea pernyi nucleopolyhedrovirus (ApNPV) lef-12 gene is 516 nucleotides in length, which encodes a putative protein of 171 amino acids with a predicted molecular mass of 19.0 kD. The 5′-noncoding region contains one consensus promoter motif (ATAAG) for late gene transcription initiation. No typical putative polyA signal (AATAAA) was found at the downstream of the translational stop codon. PSI-BLAST search result revealed that 18 lepidopteran NPVs encode ApNPV LEF-12 protein homologues. The identity of ApNPV LEF-12 protein to that of group I NPV was higher than to that of group II NPV. The Effective Number of Codons (ENCs) of ApNPV LEF-12 protein and its closely related homologues were lower than that of the others. Reverse transcriptase (RT)-PCR analysis result indicated that ApNPV lef-12 was transcribed as a late gene.

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期刊信息
  • 《蚕业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会 中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:郭锡杰
  • 地址:江苏省镇江市四摆渡中国农业科学院蚕业研究所
  • 邮编:212018
  • 邮箱:CYKE@chinajournal.net.cn
  • 电话:0511-85616835
  • 国际标准刊号:ISSN:0257-4799
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1115/S
  • 邮发代号:28-23
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊,全国农业学会优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7742