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水葫芦肌动蛋白基因片段的克隆及序列分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S555.5[农业科学—作物学] Q71[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]广东工业大学轻工化工学院,广东广州510006
  • 相关基金:国家自然科学基金(21177029); 广东省教育厅科研项目(2012KJCX0043)
中文摘要:

利用植物肌动蛋白保守片段设计简并引物,通过RT-PCR扩增出水葫芦肌动蛋白基因片段并连接到pMD19-T载体,转化E.coli,测序。序列分析结果表明,该序列与油棕、小野果蕉等植物的相似性程度达到85%以上,分子进化分析水葫芦肌动蛋白基因序列与油棕、小野果蕉等单子叶植物亲缘关系较近,但并没有与某些植物的肌动蛋白很好地聚成一类。本研究所克隆得到的水葫芦肌动蛋白基因序列能够为进一步研究水葫芦其他基因的表达提供内标。

英文摘要:

Actin gene fragment from Eichhornia crassipes was amplified with degenerate primers designed according to the conservative sequences of plant actins by RT-PCT method. It was linked to pMD19-T vector and transformed to E.coli and then sequenced. Sequence analysis showed that the degree of similarity of this sequence and sequences from Elaeis guineensis and Musa acuminate etc. reached above 85%. Phylogenetic analysis also revealed that the sequence from E.crassipes was nearer relative to sequences form some monocot plants such as E.guineensis and M.acuminate etc., but it could not be clustered into one single group with some plant sequences. The sequence of this study can provide an internal control gene for further study of other gene expression of E.crassipes.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995