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基于字符和0/1码的DNA压缩模式匹配算法
  • 期刊名称：计算机应用研究, 2007.9: 9-12
  • 时间：0
  • 分类：TP301[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构：[1]华南农业大学计算机科学与工程系,广州510642, [2]华南农业大学动物科学学院,广州510642
  • 相关基金：国家自然科学基金资助项目（60573043）;华南农业大学新学科扶持基金资助项目（4900-K03208,5600-K04098）.
  • 相关项目：分布式系统中的信任管理研究
关键词： DNA序列, 数据压缩, 压缩模式匹配, DNA sequence , data compression, compressed pattern matching
中文摘要：

分析对DNA序列数据进行压缩和压缩模式匹配的重要性,采用0/1编码的非自适应算法进行压缩,提出两类压缩模式匹配思路,设计实现了四种算法,并进行了性能比较。

英文摘要：

This paper analyzed the importance of compression and compressed pattern matching for DNA sequence data. Coding was used in no-adaptive-compression algorithm, proposed two schemes of compressed pattern matching, designed and implemented four algorithms, compared their performances.

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