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PIK3CA基因突变的MassARRAY分子量阵列分析
  • ISSN号:1673-6273
  • 期刊名称:《现代生物医学进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]第四军医大学药学院药物基因组学教研室,陕西西安710032, [2]第四军医大学西京医院病理科,陕西西安710032, [3]西北大学国家微检测系统工程技术研究中心,陕西西安710069
  • 相关基金:国家重点基础研究发展规划(973)课题资助(2010CB933900),陕西省科技攻关项目(2008K09-09)和西安市科技计划项目(SF09027)资助
中文摘要:

目的:利用MassARRAY分子量阵列分析系统检测胃癌组织PIK3CA基因突变。方法:从胃癌石蜡包埋组织中提取基因组,PCR反应扩增目的基因片段,MassARRAY分子量阵列分析系统检测PIK3CA基因突变;焦磷酸测序验证检测结果。结果:中国西部地区144例胃癌组织样本中PIK3CA_E542K(1624G〉A)突变携带率为77.6%,PIK3C_LIE545K(1633G〉A)突变携带率为84%。MassARRAY分子量阵列分析系统检测结果与焦磷酸测序结果达到100%吻合。结论:建立了MassARRAY分子量阵列分析系统检测基因突变的方法,初步建立了中国西北地区汉族人群胃癌组织PIK3CA基因PIK3CA_E542K(1624G〉A)PIK3CA_E545K(1633G〉A)位点突变频数。

英文摘要:

To investigate the PIK3CA gene mutation by MALDI-TOF mass spectrometry method (MassARRAY). Methods: Genomic DNA was extracted from paraffin embedding gastric cancer tissues. Targeted PIK3CA gene fragments were amplified by PCR. The remaining and nonincorporated dNTPs were removed from amplification products by Shrimp alkaline phosphatase(SAP). Mass spectrometry detection was carried out after primer extension reaction and primer extension reaction cleanup. Results: In 144 paraffin embedding gastric cancer tissues were detected, the mutation ratio ofPIK3CA_E542K(1624G〉A) was 77.6%, and the mutation ratio of PIK3CA_E545K (1633G 〉A) was 84%. All PIK3CA mutation results were the same as pyrosequencing results. Conclusion: The MAL_ DI-TOF mass spectrometry method for PIK3CA mutation detection was successfully established. The mutation frequencies of PIK3CA_E542K (1624G〉A) and PIK3CA_E545K (1633G〉A) of gastric cancer have primarily been set up and this fotmding is only con-cerning with people of Han nationality among nor-thwest China.

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期刊信息
  • 《现代生物医学进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:黑龙江省卫生厅
  • 主办单位:黑龙江省红十字医院 黑黑龙江省红十字医院 黑龙江省森林工总医院
  • 主编:申宝忠
  • 地址:哈尔滨市南岗区花园街184号403
  • 邮编:150001
  • 邮箱:biomed_54@126.com
  • 电话:0451-82583800 53658268
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-6273
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1544/R
  • 邮发代号:14-12
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:33230