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基于转录组测序的越橘PDR转运蛋白基因的发掘及其表达分析
  • ISSN号:1000-5684
  • 期刊名称:《吉林农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S663.9[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:吉林农业大学园艺学院,长春130118
  • 相关基金:吉林省财政厅育种项目(2012004); 农业部公益性行业(农业)科研专项(201103037); 国家自然科学基金项目(31301755); 教育部博士点基金项目(20132223120004); 人事部留学人员科技活动择优资助项目
中文摘要:

以越橘果实转录组测序文库为基础,借助生物信息学方法对越橘PDR型转运蛋白基因进行鉴定,并利用实时荧光定量PCR技术对其在越橘不同器官和组织中的相对表达量进行分析。结果表明:越橘果实至少含有30个PDR转运蛋白基因;从越橘果皮和果肉差异表达文库中筛选出21个差异表达基因,且都是在果皮中上调表达的基因;通过qRT-PCR分析,发现21个PDR转运蛋白基因在越橘不同器官和组织中的表达具有组织特异性,其中有16个基因在根中表达量最高。

英文摘要:

Bioinformatics was used to identify blueberry PDR transporters based on transcriptome sequencing library of blueberry fruit. And real-time quantitative PCR was performed to analyze the relative expression levels of PDR genes in different organs and tissues of blueberry. The results showed there were at least 30 PDR transporters in blueberry fruit. Twenty-one differentially expressed genes were selected from the differences in tag frequencies in the skin and pulp libraries. And they were up-regulated genes in the skins of blueberry. The qRT-PCR results demonstrated that expression of21 PDR transporters had tissue specificity in different organs and tissues of blueberry,among which expression levels of 16 genes were the highest in the roots.

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期刊信息
  • 《吉林农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:吉林省教育厅
  • 主办单位:吉林农业大学
  • 主编:秦贵信
  • 地址:吉林省长春市新城大街2888号
  • 邮编:130118
  • 邮箱:jlndxb@vjlav.edu.cn
  • 电话:0431-84532914
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5684
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1100/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊,全国中文农业类核心期刊,中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16398