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番茄组蛋白去乙酰化酶HD2家族生物信息学及表达模式分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院华南植物园/中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室,广东广州510650, [2]中国科学院大学,北京100049
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划项目(2012CB910902);国家自然科学基金面上项目(31371308)
中文摘要:

在生物信息学分析和克隆番茄组蛋白去乙酰化酶HD2亚家族的基础上,探究了HD2家族在番茄果实发育阶段的表达模式.结果显示,番茄HD2家族有3个成员,其氨基酸序N端具有典型的MEFWG五肽基序,中部为疏水结构域分隔开的两段富含酸性氨基酸的结构域,C端的序列呈多样性,并且具有C2H2型锌指结构;亚细胞定位预测发现该家族成员均定位于细胞核,这与其参与组蛋白修饰功能相一致.表达模式结果显示,HD2基因家族在果实发育阶段中具有阶段特异性,推测其在调控番茄的果实发育方面有重要作用.

英文摘要:

Histone acetylation plays a key role in regulating chromatin organization and gene expression. In this study, we successfully identified and cloned three tomato HD2 genes, SIHDT1101, S1HDT1102 and S1HDT1103. All the three tomato HD2 proteins had a characteristic domain strueture-a conserved pentapeptide motif (MEFWG) on the N-terminal and two highly charged acidic stretches in the central part. In addition, both S1HD11101 and S1HDT1103 contained a C2H2 type zinc finger in the C terminal. Furthermore, all the three HD2 proteins were localized in the nuclear. The gene expression analysis showed that each of the three HD2 genes displayed a specific expression pattern in tomato fruit development, indicating their important functions during fruit development.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995