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实时荧光等位基因特异性扩增法快速检测K-ras癌基因点突变
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:高等学校化学学报
  • 时间:0
  • 页码:239-249
  • 语言:中文
  • 分类:Q982[生物学—人类学]
  • 作者机构:[1]华南师范大学激光生命科学研究所、激光生命科学教育部重点实验室,广州510631
  • 相关基金:国家自然科学基金(批准号:30600128,30670507,30470494)、广东省自然科学基金(批准号:015012,04010394)和广东省科技计划(批准号:2004810401011)资助.
  • 相关项目:生物磁富集与毛细管电泳电化学发光联用技术在核酸分析中的应用研究
中文摘要:

将荧光定量PCR技术与等位基因特异性扩增(Allele specific amplification,ASA)方法相结合,发展了一种可以快速检测基因点突变的实时荧光等位基因特异性扩增(Real-time ASA)方法。将该法用于检测K-ras癌基因第12位密码子发生的点突变,分别采用针对其不同点突变方式(GAT,GTY,CGT)设计的突变型引物对待测样品进行ASA,只有突变型样品能被顺利扩增出双链DNA产物,该产物才能与双链DNA染料SYBR Green I结合,发出荧光信号从而被检测到。用该法检测31例结肠癌组织中的K-ras癌基因点突变,其中有15例样品检出为突变型。Real-time ASA法可检测到样品中含量为1/1000的突变型基因,具有灵敏、快速、简便、安全、高通量和低成本等优点,可望用于大量临床样本的点突变筛查。

英文摘要:

Mutation analysis is of great importance in molecular genetics. However, conventional electropho- resis-based methods have many shortcomings, such as time-consuming, multi-step, and using radioactive iso-topes or other hazardous materials. In this work, a one-step real-time fluorescence allele specific amplification (ASA) method was developed for rapid detection of K-ras oncogene point mutation at codon 12. Thirty-one colon cancer samples were analyzed by the assay. Genome DNA was amplified by a pair of mutant specific primers, only the mutant sample could be amplified, producing double-stranded DNA product, which can be detected by the fluorescence of SYBR Green I , a double-stranded DNA-selective fluorescent dye. The results show that the sensitivity of the assay was 1/1000 of mutant/wild-type DNAs. The positive rate for K-ras onco-gene point mutation was 48.4%. The real-time fluorescence ASA method is rapid, simple, sensitive, safe, high throughput, and low cost. It can be used for screening a large amount of clinical samples.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676