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苎麻EST-SSR引物开发和高多态性位点分析
  • ISSN号:1002-1302
  • 期刊名称:江苏农业科学
  • 时间:2012.3.3
  • 页码:25-27
  • 分类:S563.101[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]九江学院生命科学学院,江西九江332000, [2]江西农业大学理学院,江西南昌330045
  • 相关基金:国家自然科学基金(编号:31060050);江西省自然科学基金(编号:2008GZN0044);江西省教育厅重点科研项目(编号:GJJ08431);江西省九江市科技项目.
  • 相关项目:栽培苎麻逃逸对其野生居群遗传结构的影响
中文摘要:

根据NCBI数据库中苎麻表达序列标签EST数据设计7对EST-SSR引物,筛选出2对多态性引物,增加睇R的可用引物数量,进一步完善SSR分子标记体系;采用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、基因分型和测序等3种方法,分析苎麻2个高多态微卫星位点。结果表明:一个微卫星不仅有重复单元次数的变化,而且其两翼也存在简单序列变异,包括核苷酸插入、删除和碱基替换;另一个复合型微卫星各组分均存在碱基增加或删除和碱基置换。根据该位点序列的高变异性,将其作为SNP分子标记,用于苎麻系统发育关系及居群遗传学研究。

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期刊信息
  • 《江苏农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江苏省农业科学院
  • 主办单位:江苏省农业科学院
  • 主编:常有宏
  • 地址:南京孝陵卫钟灵街50号
  • 邮编:210014
  • 邮箱:jsnykx@vip.163.com
  • 电话:025-84390282
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-1302
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1214/S
  • 邮发代号:28-10
  • 获奖情况:
  • 第二届国家期刊奖百种重点期刊奖,全国优秀科技期刊奖,江苏省“双十佳”期刊奖,国家期刊奖提名奖,华东地区优秀期刊,优秀农业期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:38904