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^18 O稳定同位素标记定量蛋白质组研究技术的建立与优化
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:O645.1[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]北京放射与辐射医学研究所,北京100850, [2]北京蛋白质组研究中心,北京102206, [3]沈阳药科大学,沈阳110015
  • 相关基金:本文系国家自然科学基金(No. 20505019, 20405017, 20505018)、国家重点基础研究发展规划项目(No. 2004CB518707) 和北京市科技计划重大项目(No. H030230280190)资助课题
中文摘要:

建立了^18O稳定同位素标记方法,用于复杂体系蛋白质相对定量分析.对影响蛋白质标记稳定性的实验条件进行了比较和优化.结果表明,采用酶切后标记的方法,酶切肽段在胰酶催化下,在pH 5.0的K2HPO4/KH2PO4缓冲体系中,37℃^18O标记反应16 h,绝大部分肽段即可达到100%的标记效率.对多个16O/^18O 成对肽段峰强度的动态范围及定量准确度进行了考察.结果表明,^18O标记方法是一种简便、稳定、可靠的相对定量方法,10倍动态范围内,标记率相对标准偏差在18.4%以内,^16O/^18O峰强度呈很好的线性关系.本实验考察了标记后的肽段在不同溶液体系中的稳定性,为复杂样品的预处理和预分离的溶液条件提供了依据.

英文摘要:

A method for relative quantitation of complex protein mixtures was developed with oxygen-18 labeling and mass spectrometric analysis. Some major influencing factors, such as pH, temperature and reaction time, were evaluated and optimized. The experimental results showed that a desirable labeling could be real- ized with tryptic catalyzing in a pH 5.0 buffer composed of K2 HPO4/KH2P04 for 16 hours at 37℃. Under these conditions, the efficiency of ^18O-labeling for the tryptic peptides could be up to 100%. The investigation on the dynamic range and quantitative accuracy were performed by observing and calculating the ratio of the peak intensity in mass spectra with several ^16O/^18O peptide couples from tryptic digestion of myoglobin and a favorable linear correlation with 0.99 of R2 value and 18.4% of deviation in a 1 : 10 concentration range were obtained, which indicates that the protocol developed by the study was reliable and stable.

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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455